小产权房的流转转让存在许多的束缚，因为小产权房只具有了一般商品房的运用性质，但不具有一般商品房的法令性质，其并不是商品房。所以，法令法规对商品房的相关规则和制度对小产权房是无效的，人民法院也不能适用商品房生意的法令规则及司法解说处理触及小产权房的案子，购房人的权益很难得到维护。
一起，因为购买小产权房的合同是无效的，因而根据法令规则购房人只能要求开发商交还购房款并按银行同期借款利率付出利息等。因为小产权房不受法令认可，也不必在房管部分存案，不在政府机构监管范围内，因而在运用房子的过程中，如果遇到一些房子质量问题、公共设施维护问题，其救济途径就十分有限。
购买在建小产权房的情况下，购房人与开发商签订合同并交给房款后，如果相关部分整理小产权房的建造项目，可能就会导致部分项目停建乃至被逼迫撤除。结果只能是购房人找开发商索要购房款，购房人就可能面临既无法获得房子，又不能及时索回房款的为难地步。
别的，购房后如果遇到国家征地拆迁，因为小产权房没有国家认可的合法产权，购房人并非合法的产权人，所以其很可能无法得到对产权进行的拆迁补偿，而作为实际运用人所得到的拆迁补偿与产权补偿比较是微乎其微的。
小产权房子的开发建造还没有清晰的规则加以束缚，开发建造的监管相同存在缺位。而小产权房子的开发得不到银行借款支持，开发过程中其很多的开发资金没有政府和银行进行监管，主要依托开发商自律进行开发建造，一旦开发单位的资金或其它环节出现问题，极有可能变成烂尾工程。
如果是将购房资金预交给没有任何资质和监管的开发单位，对购房者而言，资金的安全，开发商资金是否准时到位，是否可以按质准时的交给房子存在着很大的风险。一起，开发单位的资质没有，房子质量和房子售后保修难以确保。并且，入住后的物业管理也极易出现问题。
因为所购小产权房得不到法令的认可和维护，没有得到国家房地产主管部分的同意，无法处理合法的产权手续，购买后也不能合法转让过户，购房者也就无法获得房子所有权。
1、小产权房交易是违法的，是国家和法律禁止的，所以得不到法律的保护。 2、因违法，所以就存在被拆除或没收，并得不到有效补偿的风险存在。2009年6月2日出台的《深圳市人民代表大会常务委员会关于农村城市化历史遗留违法建筑的处理决定》(以下简称《决定》第五条规定“经普查记录的违法建筑，市政府应当区别其违法程度，根据本决定以及土地利用总体规划、城市规划和土地利用计划要求，分别采用确认产权、依法拆除或者没收、临时使用等方式，分期分批处理。” 3、违约或一房多卖或房子的其他权利瑕疵等情况容易发生。因 小产权房买卖 是非法的，所以当一方反悔时，就可以 主张合同无效 而又因小产权房没有有效登记，所以第三方根本无法查到买卖情况或是房子的权益状态，所以容易一房多卖或者其他权利瑕疵4、转让手续虽然简单，但是毕竟违法，也造成了再转让困难，而且升值的空间也不大。
小产权房指的是在农村集体土地上建设的房屋，未缴纳土地出让金等费用，其产权证不是由国家房管部门颁发，而是由乡政府或村政府颁发，亦称“乡产权房”。“小产权房”不是法律概念，是人们在社会实践中形成的一种约定俗成的称谓。该类房没有国家发放的土地使用证和预售许可证，购房合同在国土房管局不会给予备案。所谓产权证亦不是真正合法有效的产权证。所以大家在购买房产的时候，做好不要购买小产权房。
小产权房购买的风险有：
1、法律效力：“小产权房”买卖合同的效力一般认定无效为原则。
2、房产转让：“小产权房”拿不到正式的房产证，因此并不构成真正法律意义上的产权。即小产权房只有使用权，没有所有权。所以小产权房是不能向非本集体成员的第三人转让或出售，即购买后不能合法转让过户。其同时对房屋的保值和升值也有一定影响。
3、政策风险：当购买了小产权房时，购房人与开发商签订合同并交付房款后，如果相关部门整顿乡产权房的建设项目，可导致部分项目停建甚至被强迫拆除。购房人会面临既无法取得房屋，又不能及时索回房款的尴尬境地。
4、监管缺位乡产权房屋的开发建设没有明确的规定加以约束，开发建设的监管存在缺位，对购房者的利益有一定的影响。同时，开发单位的资质没有，房屋质量和房屋售后保修难以保证。
