DNA的乙醇沉淀
沉淀DNA 样品能达到浓缩的目的,而且沉淀也会去除阻止许多酶反应的残留氯仿。
一、步骤
于最多体积450 μl 的DNA 样品中,加入1/10体积pH4.2的3 mol/L NaAc, 快速颠倒以混匀。
加入2倍体积95%乙醇或无水乙醇,充分混匀。
样品踩于冷环境中沉淀:-20℃ 过夜,或-70℃30 min, 或干冰中5 min 。
使用干冰进行乙醇沉淀
用锤子将干冰砸成粉末,再将管子插入粉末;或将干冰砸成小块,置于抗冻容器中,加入95% 乙醇捣成稀泥,插入管子。 注意:乙醇会洗去标签。
图一 离心之后离心管中分为两层
1:上县为水相,包含着DNA ,下层为有机相,包含蛋白质。通常存水相与有机相之间有一个中间层,可见一个白色带, 这是一些被抽提出来的蛋白质。在你吸取水相的时候,不要碰那个白色带。
高速离心样品15 – 30 min, 转速至少12000g, 如果没有冷冻离心机,将离心机置于4℃ 。
除去上清,上清可以倒入下水道中。
离心管倒置于纸巾上吸干。
预冷的70%乙醇洗涤沉淀。
按步骤6干燥或使用真空浓缩机。
用pH8.0 的TE (10mmol/L Tris· HCI, 0.1 mmol/L EDTA) 重悬DNA 。如果沉淀不能完全溶解,加入更多的TE, 将样品保存于4℃。
三、温馨提示
在处理大分子DNA (大于30 kb) 时要特别小心,由于DNA 样品不能抹荡,只能颠倒或转动混匀。去除表面的氯仿,代替用乙醇沉淀DNA 样品的是, DNA 溶液需要对大体积的冷TNE 溶液进行透析或用水饱和的乙醚抽提。
乙醇的优点是可以任意比和水相混溶,乙醇与核酸不会起任何化学反应,对DNA很安全,因此是理想的沉淀剂。
DNA 溶液是DNA以水合状态稳定存在,当加入乙醇时,乙醇会夺DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚合。一般实验中,是加2倍体积的无水乙醇与DNA相混 合,其乙醇的最终含量占67%左右。因而也可改用95%乙醇来替代懈水乙醇(因为无水乙醇的价格远远比95%乙醇昂贵)。但是加95%的乙醇使总体积增 大,而DNA在溶液中有一定程度的溶解,因而DNA损失也增大,尤其用多次乙醇沉淀时,就会影响收得率。折中的做法初次沉淀DNA时可用95%乙醇代替无水乙醇,最后的沉淀步骤要使用无水乙醇。也可以用0.6倍体积的异丙醇选择性沉淀DNA.一般在室温下放置15-30分钟即可。
乙醇:乙醇是一种有机物,俗称酒精,化学式为CH3CH2OH(C2H6O或C2H5OH)或EtOH,是带有一个羟基的饱和一元醇,在常温、常压下是一种易燃、易挥发的无色透明液体,它的水溶液具有酒香的气味,并略带刺激。有酒的气味和刺激的辛辣滋味,微甘。
乙醇液体密度是0.789g/cm(20C°) ,乙醇气体密度为1.59kg/m,沸点是78.3℃,熔点是-114.1℃,易燃,其蒸气能与空气形成爆炸性混合物,能与水以任意比互溶。能与氯仿、乙醚、甲醇、丙酮和其他多数有机溶剂混溶,相对密度(d15.56)0.816。
乙醇的用途很广,可用乙醇制造醋酸、饮料、香精、染料、燃料等。医疗上也常用体积分数为70%-75%的乙醇作消毒剂等,在国防工业、医疗卫生、有机合成、食品工业、工农业生产中都有广泛的用途。
DNA:脱氧核糖核酸(英语:Deoxyribonucleic acid,缩写为DNA)又称去氧核糖核酸,是一种分子,双链结构,由脱氧核糖核苷酸(成分为:脱氧核糖及四种含氮碱基)组成。可组成遗传指令,引导生物发育与生命机能运作。
主要功能是长期性的资讯储存,可比喻为"蓝图"或"食谱"。其中包含的指令,是建构细胞内其他的化合物,如蛋白质与RNA所需。
带有遗传讯息的DNA片段称为基因,其他的DNA序列,有些直接以自身构造发挥作用,有些则参与调控遗传讯息的表现。
组成简单生命最少要265到350个基因 。
若在碱性条件(氢氧化钠)下,
此题主要考察的是碘仿反应的,另外,碘可以氧化乙醇,邢大本上有的.
乙醇和碘反应:CH3CH2OH+I2=CH3CHO+HI,CH3CHO+I2+H2O→HCOOH+HCI3↓(碘仿,浅黄色沉淀)
乙醛和碘反应:CH3CHO+3I2+H2O→HCOOH++3HI+HCI3↓(碘仿,浅黄色沉淀)
丙酮和碘反应:CH3COCH3+3I2+H2O→CH3COOH+3HI+HCI3↓(碘仿,浅黄色沉淀)
环己酮和碘:酮的左右4个氢被碘取代.
若在酸性条件下,
乙醇和碘不反应
乙醛和碘反应:CH3CHO+I2→CH2ICHO+HI
丙酮和碘反应:CH3COCH3+2I2→CH2ICOCH2I+2HI
环己酮和碘:酮的左右各1个氢被碘取代.
提取液中加入等体积预冷的5mol/L
Licl
充分混匀,1000rpm
4℃离心15min,取上清。
加等体积异丙醇,混匀,室温放置10min,10000rpm
4℃离心15min。
弃上清,纯点加入70%乙醇洗涤一次,沉淀风干10~15min。
500ul,含RNA酶的TE(pH8.0)溶解沉淀,室温放置30min。(将质粒RNaesA混合物用酚:氯仿抽提一次,然后用氯仿抽提一次)
用2.5倍体积无水乙醇沉淀质粒,风干10min。
加1ml灭菌水溶解沉淀,加500ul
PEG-MgCl2溶液,充分混合,室温10min,12000rpm
4℃离心15min。
用70%乙醇重悬沉淀,12000rpm
4℃离心15min。
弃上清,沉淀用70%乙醇处理一次,最后将质粒,溶于500ulTE(pH8.0)中,取1ul质粒DNA,100倍稀释后测OD260,计算DNA的浓度,其余封装,-20℃保存备用。
2.乙醇可以吸附水分子(极性相同),使得溶液中相对的水分子减少,增大了DNA在水中的相对浓度.
3.附:乙醇沉淀DNA需要盐离子,用金属离子屏蔽DNA上磷酸的负电荷,降低DNA分子间的斥力,才能沉淀完全.
蛋白质含量,离子强度,溶液pH值,乙醇浓度,溶液温度。
1。蛋白质含量,愈高,共沉多;反之,分离愈彻底。当然有度。溶液太稀了,成本高。
2。离子强度:这与介电强度有关。
3。溶液pH值:调到目标蛋白等电点周围。
4。乙醇浓度:一般来说乙醇浓度多少,与目标蛋白的分子量有关:比如8%,可沉淀纤维蛋白原,20%可沉淀球蛋白,40%可沉淀白蛋白等等,当然,乙醇浓度与溶液pH值配合使用。加入乙醇不能过快,防止局部过浓。要边加边摇动。
否则,共沉多!或者局部变性。
5。溶液温度:必须低温,乙醇反应是个放热反应,如果温度高,可引起蛋白质变性,不可逆的变形。
这五变参数,要综合,动态的调整,可达到精确分离蛋白质的作用。