苯酚:氯仿:异戊醇为什么要25:24:1?
通常,氯仿与异戊基发酵的比例为24:1。 苯酚,氯仿和异戊醇的比例也可以按25:24:1的比例使用。
提取DNA时,为了均匀混合,必须将容器摇动几次,并且在混合溶液中容易产生气泡,并且气泡会阻止相互作用。 异戊醇的添加降低了分子的表面张力,因此减少了萃取过程中泡沫的产生。
扩展资料酚:氯仿:异戊醇试剂是由水饱和酚、氯仿和异戊醇按125:24:1 的体积比混合而成的,主要用于RNA的提取等试验。苯酚使蛋白质变性,同时抑制了 RNase 的降解作用。
氯仿抽提加速有机相与液相分层,去除核酸溶液中的迹量酚。异戊醇减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。使用酚:氯仿:异戊醇抽提离心后的上层为含 RNA 的水相、中间为变性蛋白与 DNA,下层为有机溶剂相。静置后产品有分层现象,使用时将产品摇匀后用移液器吸取即可。
注意事项:酚:氯仿:异戊醇试剂有较强的腐蚀性,应尽量避免皮肤接触或吸入体内。如发现变为红色或棕色,表明已发生氧化,不能继续使用。
参考资料来源:百度百科-苯酚
参考资料来源:百度百科-氯仿
参考资料来源:百度百科-异戊醇
苯酚、氯仿、异戊醇抽提DNA的原理是通过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质,再加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来.
使用苯酚抽提细胞 DNA 时,苯酚的作用是使蛋白质变性,同时抑制了 DNase 的降解作用.用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与 DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶.蛋白分子溶于酚相,而 DNA 溶于水相.
氯仿的作用是克服酚的缺点;加速有机相与液相分层.最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚.(酚易溶于氯仿中)
用酚-氯仿抽提细胞基因组 DNA 时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?因为异戊醇可以减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡.异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡 产生.另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含 DNA 的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定.
酞与氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去,使蛋白失去水合状态而变性过离心,变性蛋白质的密度比水的密度为大,因而与分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA分开.
水相异戊醇的目的是减少抽提过程中的泡沫产生,原理如下:
在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用.加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生.
上层是水.
氯仿:使有机相和水相易分层,增加核酸得率,同时可除去脂类.
1. 说明:从核酸样品中除去蛋白质时常常使用苯酚/氯仿/异戊醇(25 : 24 : 1).氯仿可使蛋白质变性并有助于液相与有机相的分离,而异戊醇则有助于消除抽提过程中出现的气泡.
2. 配制方法:将Tris-HCl平衡苯酚与等体积的氯仿/异戊醇(24 : 1)混合均匀后,移入棕色玻璃瓶中4℃保存.
1、氯仿的体积比水(也就是Trizol)略少,出现了乳化现象,补加一点氯仿再多静置一会儿即可;
2、使用的氯仿已经变质(如吸水等因素),造成乳化现象,所以不分层。
望采纳,谢谢!
常见问题就是除杂不彻底,除杂过程导致DNA断裂。
我做实验,材料里蛋白不太多不用苯酚,氯仿:异戊醇24:1就可以了。
操作中一定要把溶液混匀,这样离心后除杂效果才好!混匀过程要温柔,以免DNA断裂。
刚期末考完居然有人问……要再过一星期我就回答不出来了5555