苯酚:氯仿:异戊醇为什么要25:24:1?
通常,氯仿与异戊基发酵的比例为24:1。 苯酚,氯仿和异戊醇的比例也可以按25:24:1的比例使用。
提取DNA时,为了均匀混合,必须将容器摇动几次,并且在混合溶液中容易产生气泡,并且气泡会阻止相互作用。 异戊醇的添加降低了分子的表面张力,因此减少了萃取过程中泡沫的产生。
扩展资料酚:氯仿:异戊醇试剂是由水饱和酚、氯仿和异戊醇按125:24:1 的体积比混合而成的,主要用于RNA的提取等试验。苯酚使蛋白质变性,同时抑制了 RNase 的降解作用。
氯仿抽提加速有机相与液相分层,去除核酸溶液中的迹量酚。异戊醇减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。使用酚:氯仿:异戊醇抽提离心后的上层为含 RNA 的水相、中间为变性蛋白与 DNA,下层为有机溶剂相。静置后产品有分层现象,使用时将产品摇匀后用移液器吸取即可。
注意事项:酚:氯仿:异戊醇试剂有较强的腐蚀性,应尽量避免皮肤接触或吸入体内。如发现变为红色或棕色,表明已发生氧化,不能继续使用。
参考资料来源:百度百科-苯酚
参考资料来源:百度百科-氯仿
参考资料来源:百度百科-异戊醇
苯酚、氯仿、异戊醇抽提DNA的原理是通过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质,再加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来.
使用苯酚抽提细胞 DNA 时,苯酚的作用是使蛋白质变性,同时抑制了 DNase 的降解作用.用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与 DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶.蛋白分子溶于酚相,而 DNA 溶于水相.
氯仿的作用是克服酚的缺点;加速有机相与液相分层.最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚.(酚易溶于氯仿中)
用酚-氯仿抽提细胞基因组 DNA 时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?因为异戊醇可以减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡.异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡 产生.另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含 DNA 的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定.
上层是水.
氯仿:使有机相和水相易分层,增加核酸得率,同时可除去脂类.
1. 说明:从核酸样品中除去蛋白质时常常使用苯酚/氯仿/异戊醇(25 : 24 : 1).氯仿可使蛋白质变性并有助于液相与有机相的分离,而异戊醇则有助于消除抽提过程中出现的气泡.
2. 配制方法:将Tris-HCl平衡苯酚与等体积的氯仿/异戊醇(24 : 1)混合均匀后,移入棕色玻璃瓶中4℃保存.
1、氯仿的体积比水(也就是Trizol)略少,出现了乳化现象,补加一点氯仿再多静置一会儿即可;
2、使用的氯仿已经变质(如吸水等因素),造成乳化现象,所以不分层。
望采纳,谢谢!
剧烈振荡可使DNA断裂,故操作时应尽量轻柔、缓慢地颠倒混匀。
要获得高纯度DNA,可加入蛋白酶K降解蛋白质。
DNA在260nm处有一吸收峰,而蛋白质在280nm处有吸收峰。当纯度比值小于1.6时,应考虑进行再次纯化。
整个实验须接触多种有毒、有腐蚀性试剂,故应注意操作规范安全。
刚期末考完居然有人问……要再过一星期我就回答不出来了5555
CTAB提取缓冲液的经典配方
Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;
EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;
NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,在于液相中; CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离;
β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除
PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖。
用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?
使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。
使用酚的优点:1.有效变性蛋白质;2抑制了DNase的降解作用。缺点:1.能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。2.不能完全抑制RNase的活性。
氯仿的作用?
氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。(酚易溶于氯仿中)
用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?
异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?
用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl 或 NaAc,Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。
简言之,无论哪种抽提方法,药品的作用基本都是一样的
常见问题就是除杂不彻底,除杂过程导致DNA断裂。
我做实验,材料里蛋白不太多不用苯酚,氯仿:异戊醇24:1就可以了。
操作中一定要把溶液混匀,这样离心后除杂效果才好!混匀过程要温柔,以免DNA断裂。