CTAB缓冲液怎样配制?????
Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏。
EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性。
NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中。
Cβ-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除基因组DNA。CTAB 4g
NaCl 16.364 g。
1M Tris-HCl 20ml( PH8.0)。。
0.5M EDTA 8ml,先用70ml ddH2O溶解, 再定容至200ml灭菌。
冷却后0.2-1% 2-巯基乙醇(400ul)氯仿-异戊醇(24:1):先加96ml氯仿,再加4ml异戊醇,摇匀即可。
扩展资料:
适当的加一下热,比如50度或者60度,可以快速溶解,般这个温度对试剂的品质没有什么影响如果不是浓度太高的话。
如果浓度太高,可能冷却后又会沉淀析出来。
在高离子强度的溶液中(>0.7mol/L NaCl) CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物而不沉淀核酸。通过有机溶剂抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。
2×CTAB提取缓冲液成分:2%(w/v)CTAB,100mM Tris (pH 8.0),20mM EDTA,1.4 MNaCl,,0.2%(v/v) 还原剂(随用随加) 。
参考资料来源:百度百科——十六烷基三甲基溴化铵
可以的。
DTT和2-ME(2-mercaptoethanol的简称,下同)都属于巯基试剂。
也就是说DTT和2-ME的作用是一样的:可以防止蛋白质或酶等分子中的巯基氧化成二硫键,维持体系的还原性环境。
β-巯基乙醇和DTT都是还原剂,防止蛋白质被氧化,β-巯基乙醇常用浓度为5-20MMOL/L,DTT为0.5-1MMOL/L。因为β-巯基乙醇加入缓冲液后24小时易被氧化,其后加速蛋白质的失活,而DTT氧化后形成稳定的分子内二硫健,并不危及蛋白的巯基,所以在蛋白制备中常用β-巯基乙醇,而长期储存用DTT。还有其上提到的试剂浓度均指终浓度。
至于使用浓度,DTT和2-ME的工作浓度一般为1-5mM,如果2-ME的浓度是1mM,由于DTT的氧化能力强于2-ME,DTT的浓度用0.5-1mM就可以了。
CTAB为十六烷基三甲基溴化铵,
CTAB提取缓冲液的经典配方
Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;
EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;
NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中;
Cβ-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除基因组DNA。
CTAB 4g
NaCl 16.364 g
1M Tris-HCl 20ml( PH8.0)
0.5M EDTA 8ml,先用70ml ddH2O溶解, 再定容至200ml灭菌
冷却后0.2-1% 2-巯基乙醇(400ul)氯仿-异戊醇(24:1):先加96ml氯仿,再加4ml异戊醇,摇匀即可。
提取RNA配方
2% CTAB(W/V)
2% 聚乙烯吡咯烷酮PVP(W/V)
100 mM Tris-HCl(pH8.0,DEPC处理的水配置)
25mM EDTA
0.5g/L 亚精胺Spermidine
2.0M NaCl,2%巯基乙醇(V/V,使用前加入)
由于在高温灭菌条件下,Tris-HCl要和DEPC发生反应,所以配RNA提取缓冲液时直接用DEPC 处理的水配制即可。
CTAB提取缓冲液的经典配方
Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;
EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;
NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中;
Cβ-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除基因组DNA。
CTAB 4g
NaCl 16.364 g
1M Tris-HCl 20ml( PH8.0)
0.5M EDTA 8ml,先用70ml ddH2O溶解, 再定容至200ml灭菌
冷却后0.2-1% 2-巯基乙醇(400ul)氯仿-异戊醇(24:1):先加96ml氯仿,再加4ml异戊醇,摇匀即可。
百度知道里有这么一句:“用ctab法提取某些易发生褐变物种的dna时不加肯定会对细胞产生影响,但具体会有何影响则视具体物种,操作环境和具体方法的不同而定”。虽然百度知道的可信性有点...不过物种不同所以效果不同也的确是普遍存在的现象。
我做实验的感觉是,东西做出来是王道,现成的protocol只是参考。比如我自己提蛋白用的裂解液的配方是自己摸出来的,跟其他人和文献上都不一样。如果你们实验室这种提取方法提取出的dna质量的确好,并且是可重复的,那就这么做好了。机理细节,也许就是物种特异性、氧化性不强,也有可能是你们用的这一批巯基乙醇质量一般,或者混入了其他东西。如果想要验证,可以再买另一个公司的试试,当然如果只focus在dna上,并且现在已经很好了,就这么做下去也不妨。不是不求甚解,而是主次有别。
植物学门外汉,一家之言,仅供参考。祝实验顺利=)
SDS使蛋白质变性,用于确定蛋白分子量的聚丙烯酰胺凝胶电泳。也可以用于核酸抽提操作中破坏细胞壁及裂解核酸-蛋白复合物。在乳液聚合反应中,可充当两相溶液的乳化剂。
巯基乙醇用于打开二硫键的,使蛋白质的四级或三级结构被破坏。
甘油使样品处于下面,不易飘起,并有保护作用。
溴酚蓝用于显色,起指示作用。
扩展资料
SDS的用途
1、用作洗涤剂和纺织助剂,也用作牙膏起泡剂、矿井灭火剂、乳液聚合乳化剂、羊毛净洗剂等。
2、用作阴离子型表面活化剂、乳化剂及发泡剂。
3、GB 2760-96规定为食品工业用加工助剂。发泡剂;乳化剂;阴离子型表面活性剂。用于蛋糕、饮料、蛋白、鲜果、果汁饮料、食用油等。
4、用作药物、化妆品、合成树脂的乳化剂。牙膏、灭火器的发泡剂。用作丝毛类精品织物的洗涤剂。金属选矿的浮选剂。
5、用作洗涤和纺织助剂,也用作牙膏发泡剂,灭火泡沫液,乳液聚合乳化剂,医药用乳化分散剂,洗发剂等化妆制品,羊毛净洗剂。
6、生化分析,电泳,离子对试剂。
1)Promega有哪些系统用于提取总RNA及poly(A)+RNA?
2)RNAgents®总RNA提取系统的工作原理怎样?
3)RNAgents®总RNA提取系统的一般得率是多少?
4)RNAgents®总RNA提取系统的各组分的功能是什么?
5)RNAgents®总RNA提取系统中平衡的苯酚:氯仿:异戊醇的配比是多少?
6)对初始材料的用量有什么限制?
7)提取RNA用作RT-PCR的方法作了哪些修改?
--------------------------------------------------------------------------------
1)Promega有哪些系统用于提取总RNA及poly(A)+RNA?
Promega用于提取总RNA及poly(A)+RNA的系统包括:
:用RNAgents®总RNA提取系统从组织及培养的细胞中提取总RNA。
:用SV总RNA提取系统从组织,血液及培养的细胞中提取总RNA。
:用PolyATtract®mRNA提取系统从总RNA中提取poly(A)+RNA。
:用PolyTtract®ystem1000从组织及培养的细胞中提取poly(A)+RNA。
:用PolyTtract®Series
9600TMmRNA从少量样品中快速提取mRNA(cDNA第一条链的纯化)。
2)RNAgents®提取总RNA提取系统的工作原理怎样?
RNAgents®总RNA提取系统用溶剂法为基础,从多种材料中快速,有效地提取总RNA。
简单而言,有亚硫氢胍及巯基乙醇时,制组织匀浆,可使内源的RNA酶失活,n-月桂肌氨酸将核蛋白复合物变性。用酸平衡的苯酚:氯仿:异戊醇抽提后,RNA脱离DNA及蛋白,从混合液中层析到水相。抽提后,用异丙醇将RNA沉淀浓缩。用RNAgents®总RNA提取系统所得RNA纯度好,用途广,适用于PolyATtract®mRNA提取系统。如RNA中必须完全去除染色体DNA,需用1-2个单位的无RNA酶污染的DNA酶处理。然后用65oC加热10分钟,或用苯酚及氯仿抽提使DNA酶失活。
3)RNAgents®总RNA提取系统的一般得率是多少?
得率受多个因素的影响,包括组织来源及培养的细胞数。如提取的RNA量多,可通过光吸收测定(A260读数)来定量RNA,
1OD=40ugRNA。
RNAgents®总RNA提取系统的一般得率
组织
总RNA得率
Hela细胞
1.6mgRNA/10的8次方个细胞
鼠内脏
2.3mgRNA/g组织
鼠脾
8.3mgRNA/g组织
鼠肺
1.9mgRNA/g组织
鼠肾
3.1mgRNA/g组织
鼠肝
8.1mgRNA/g组织
4)RNAgents®总RNA提取系统的各组分的功能是什么?
(1)
变性剂:
柠檬酸钠溶液中含亚硫氢胍,巯基乙醇,n-月桂肌氨酸
。可变性细胞内及核蛋白复合物,释放RNA。这些试剂还可有效抑制核酸酶。
(2)
苯酚:氯仿:异戊醇(125:24:1)(pH4.7):酸平衡苯仿可抽提去除杂物。DNA及蛋白沉淀到有机相,RNA留在水相。酸性有机溶剂的抽提可免除用氯化锂选择沉淀RNA。用锂沉淀导致小于5.8sRNA的丢失,并不利于下游操作。
(3)
乙酸钠(pH4.0):维持变性的细胞裂解液的pH值,及沉淀RNA所需。
(4)
异丙醇:沉淀浓缩RNA。
5)RNAgents®总RNA提取系统中平衡的苯酚:氯仿:异戊醇的配比是多少?
苯酚:氯仿:异戊醇的配比是125:24:1,用42mM柠檬酸钠溶液平衡(pH4.3-4.7)。这一配比可有效去除染色体DNA。残留染色体DNA会干扰RT-PCR。
6)对初始材料的用量有什么限制?
最初的设计方案是用作提取比较大量的RNA,RNAgents®总RNA提取系统可从5mg
组织,或5倍10的5次方的细胞中提取RNA。少量RNA提取的步骤可见RNAgents®总RNA提取系统技术手册TB087。初始材料用量的上限是每次用1g组织。
7)提取RNA用作RT-PCR的方法作了哪些修改?
快速提取RNA用作RT-PCR,可省去在变性溶液中液化和沉淀的步骤。简化的步骤可在90分钟内完成。
http://www.promega.com.cn/files/changjian/rnagents.htm