酵母rna的提取酸性乙醇加错了怎么补救
前面提取的RNA经异丙醇沉淀后,总会含有一些未除去的蛋白和其它杂质分子,这些蛋白和杂质分子如果不除尽的话,就会直接影响所提取的RNA的纯度和稳定性。
为此,就需要用70%乙醇洗涤沉淀(因为在70%乙醇里RNA是不溶的,而一些蛋白和其它杂质分子却可。
提rna异丙醇加反了影响实验的准确性。根据相关信息查询:提rna加错了异丙醇会导致醇类的浓度生高,RNA沉淀的增多,影响实验的准确性。异丙醇(IPA),又名2-丙醇,是一种有机化合物,化学式是CHO,是正丙醇的同分异构体,为无色透明液体,有似乙醇和丙酮混合物的气味。
假设你现有的乙醇浓度为a%,要配75%的乙醇溶液,就是取75ml,加水至a
ml(可按比例减小)。DEPC水也一样的。
希望对你有所帮助,望采纳。
1、测量核酸含量时应进行三次重复(因为机器也有误差)
2、RNA完整度
(?)A260/A280为2.1-2.2是正常范围(?)
3、跑胶验证RNA完整性(理论上在提取RNA后,不仅应该测量吸光度的比值,也应当跑胶进行完整性验证。因为机器的吸光度只是一个大致参考)
(?)配胶注意事项(?)
4、稀释
(1)在进行反转时,RNA需要按照试剂盒的浓度进行稀释,但不要稀释浓度过低。一般200—250ng/ml即可。
(在进行反转时一定要注意计算自己需要多少rDNA,以便进行后续实验。一般把RNA全都进行反转?)
(2)在进行反转录之前进行浓度测量,稀释至浓度一致即可。在进行反转录之后不用再进行浓度测量,因为此时的体系中有裂解的RNA,反转录的DNA等,无法进行测量。在反转录之前保持浓度一致即可。
(3)稀释时要先拿移液枪抽取一定量的RNA,进行准确测量,然后再进行稀释。
5、分装
不论是RNA还是反转录DNA都需要分装(反复冻融容易造成样品降解,至少平均分装成三份)
一直困惑于提总RNA的260/230纯度阴晴不定,后来仔细思量下来,发现自己干了蠢事——在洗涤RNA时需要使用75%的乙醇。对于这个步骤,可能未给予太大重视(经常是使用前期配制的,放置了很久的乙醇),结果是每次260/230的结果出来总是飘忽不定!
在对整个流程深入梳理发现,这个环节出课题概率最大,毕竟每次自己新鲜配制乙醇,得出来的260/230都是很完美的,而陈旧乙醇时就开始作妖了。所以——切记每次都必须使用新鲜配制的乙醇!
称取鲜酵母 159或干酵母粉 2.5g,倒入 100ml三角瓶中,加 NaCl 2.5g,水25ml,搅拌均匀,置于沸水浴中提取lh.
2.分离
将上述提取液用自来水冷却后,装入大离心管内,以4000r/min离心10min,使提取液与菌体残渣等分离.
3.沉淀RNA
将离心得到的上清液倾于50ml烧杯内,并置入放有冰块的250ml烧杯中冷却.待冷至10℃以下时,用6mol/L HCI 小心地调节pH值至2.0~2.5(注意严格控制pH).调好后继续于冰水中静置10min,使沉淀充分,颗粒变大.
4.洗涤和抽滤
上述悬浮液以 4000r/min离心 10min,得到 RNA沉淀.将沉淀物放在 10ml小烧杯内,用95%的乙醇 5~10ml充分搅拌洗涤,然后在布氏漏斗上用射水泵抽气过滤,再用 95%乙醇5~10ml淋洗 3次.
5.干燥
从布氏漏斗上取下沉淀物,放在6cm表面皿上,铺成薄层,置于80℃烘箱内干燥.将干燥后的RNA制品称重,存放于干燥器内.
应该是这里的某个步骤错了吧!
RNA提取步骤及注意事项(仅供参考):
实验步骤如下:
1.取50—100mg的组织,加入1ml Trizol试剂,用匀浆器打匀(Trizol先放于冰上)。
2.将匀浆室温放置5min。
3.加入200μl氯仿,剧烈震荡混匀30s,冰上静置3min。
4.12000rpm,4℃离心15min。
5.将上清液小心转移到新的1.5ml离心管中(取400μl),加入等量体积的异丙醇,上下颠倒几次混匀,室温下放置15min。(此步中注意:不要吸取任何中间层物质,宁缺勿烂。)
6.12000rpm,4℃离心15min。
7.小心移去上清液,防止RNA沉淀丢失。
8.用70%乙醇(DEPC处理的水配制)洗涤1次,加入700μl乙醇,将RNA沉淀弹起,漂洗。(此时RNA是不溶解的)
9.8000rpm,室温离心10min。
10.尽可能彻底地吸走上清,防止RNA沉淀丢失。
11.真空离心干燥3—5分钟,或放在室温下使乙醇完全挥发掉。
12.沉淀用30μl DEPC-H2O溶解。如发现沉淀难溶,68℃处理10min。
13.RNA检测
(1)测定样品在260nm和280nm的吸光值按1OD=40μg/ml RNA计算RNA的产量。
OD260/OD280在1.8-2.0。
(2)进行甲醛变性琼脂糖凝胶电泳,确定RNA的完整性和污染情况。
注意事项:
1.获得RNA效率低有一下原因
a:样品裂解或匀浆处理不彻底
b:最后得到地RNA沉淀未完全溶解
2.A260/A280<1.65原因
a:检测吸光度时,RNA样品不是溶于TE,而是溶于水。低离子浓度和低PH条件下,A280值会较高
b:样品匀浆时加地试剂量太少
c:匀浆后样品未在室温放置2分钟
d:水相中混有有机相
e:最后得到地RNA沉淀未完全溶解
3.RNA降解原因
a:组织取出后没有马上处理或冷冻
b:样品或提取地RNA沉淀保存于-5--20度,未在-60--70度保存
c:细胞在胰酶处理时被破坏
d:溶液或离心管未经RBase去处理
260/230比值偏小,是有盐污染,解决的办法是:
在乙醇洗脱步骤时:
1、75%乙醇,4℃,7500g/min,离心5min;
2、倒掉乙醇,再加入75%乙醇,条件同上,做第二次洗脱(注意,这次EP管在离心机
里的摆放方向与第一次相反,以便能更全面的洗脱);
3、再次掉转EP管在离心机中的方向(不再加入乙醇),7500g/min,4℃,离心3min
后,用200μl的枪小心吸去乙醇(注意不要吸到管底的RNA),然后开盖晾干乙醇即
可。
这样做后,比只用乙醇洗一次的效果要好很多,我们所提RNA用nanodrop测得260/230
值均在2.0左右。
注意倒掉乙醇后再离心一次,把沾在管壁的乙醇离下来
大神们求助求助,显示卡问题具体显示卡什么问题:
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