三氯乙酸和乙酸铅沉淀蛋白质的原理是
变性作用是蛋白质受物理或化学因素的影响，改变其分子内部结构和性质的作用。一般认为蛋白质的二级结构和三级结构有了改变或遭到破坏，都是变性的结果。能使蛋白质变性的化学方法有加强酸、强碱、重金属盐、尿素、乙醇、丙酮等；能使蛋白质变性的物理方法有加热(高温)、紫外线及x射线照射、超声波、剧烈振荡或搅拌等。
三氯乙酸是强酸，铅离子是重金属，这2者均可以使蛋白质变性沉淀。
三氯乙酸沉淀蛋白质不可逆。
三氯乙酸在酸性条件下与蛋白质形成不溶性盐，作为蛋白质变性剂使蛋白质构象发生改变，暴露出较多的疏水性基团，使之聚集沉淀。
三氯乙酸用作化学试剂、蛋白质沉淀及色谱分析试剂；三磷酸腺苷、细胞色素丙和胎盘脂多糖提取剂和农药除草剂；是杀虫剂毒死蜱的中间体，也是医药中间体；是医药上的除疣剂和收敛剂。
三氯乙酸沉淀蛋白方法：
加1/4体积的 TCA+DOC于蛋白质组分（置1.5-ml聚丙烯微量离心管中），至TCA的终浓度为20%（w/v），震荡混合，冰上解育20~30 min。
微型离心机，室温离心15 min。沉淀物如可见，为粘稠的带黄褐色的胶状物。用一精细的巴氏吸管吸出上清。努力除去尽可能多的上清。如取100ul样品进行沉淀，沉淀物将是可见的。
加3倍体积原样品体积的丙酮（室温），样品在室温下静置约10min，使TCA+DOC溶于丙酮。
室温离心15min，其时，沉淀物的大小和物理特性类似于一点灰尘。约10ug或更多一点的蛋白质即可看见。有时，会得到白色的盐类（如KCl等）沉淀物。
用极精细的巴氏吸管移去上清。沉淀物置冰上干燥10 min(敞开1.5-ml离心管的盖)。干燥的沉淀物可长时间（>1 个月）地保存于-20℃。
三氯乙酸沉淀蛋白质不可逆。
在酸性条件下，与蛋白质形成不溶性盐而沉淀下来；与蛋白质分子内部的疏水基团作用，使之暴露出来，造成蛋白质变性，从而相互凝聚沉淀下来。
随着蛋白质分子量的增大，其结构复杂性与致密性越大，TCA可能渗入分子内部而使之较难被完全除去，在电泳前样品加热处理时可能使蛋白质结构发生酸水解而形成碎片，而且随时间的延长这一作用愈加明显。
三氯乙酸沉淀蛋白原理：
① 在酸性条件下与蛋白质形成不溶性盐。
② 作为蛋白质变性剂使蛋白质构象发生改变，暴露出较多的疏水性基团, 使之聚集沉淀。
③ 随着蛋白质分子量的增大，其结构复杂性与致密性越大，TCA 可能渗入分子内部而使之较难被完全除去，在电泳前样品加热处理时可能使蛋白质结构发生酸水解而形成碎片，而且随时间的延长这一作用愈加明显。
①在酸性条件下与蛋白质形成不溶性盐.
②作为蛋白质变性剂使蛋白质构象发生改变，暴露出较多的疏水性基团，使之聚集沉淀.
③随着蛋白质分子量的增大，其结构复杂性与致密性越大，TCA可能渗入分子内部而使之较难被完全除去，在电泳前样品加热处理时可能使蛋白质结构发生酸水解而形成碎片，而且随时间的延长这一作用愈加明显； 在电泳时使用TCA对蛋白质样品的浓缩或除盐时，对于分子质量大的蛋白质，要慎重选择TCA.对小分子量蛋白质的浓缩，采用TCA时也有两点需要注意:一是用TCA沉淀后，尽量用丙酮彻底抽提TCA二是样品处理后要尽快进行电泳分析，以免发生聚集及断裂，造成结果分析的不准确。
