羧基和胍基的反应条件是什么。醋酸和盐酸胍在水溶液里的反应吗,除了水之外,没有其它的东西?
羧基和胍基在水溶液里不易反应,原因在于各自会形成各自的离子。
羧基在水中部分电离;而胍基接近强碱,几乎完全形成阳离子。所以此时胍基上的氮难有亲核的力量。又:羧基和胍基的反应是要脱去水的,在水溶液中因为有水,平衡大大向反应物偏移。
因此醋酸和盐酸胍在不太浓的水溶液中是不易反应的。
如试图合成羧基和胍基缩合的产物,须用醋酸胍在醋酸条件下加热回流脱水。一般而言羧基和胍基的缩合反应,其条件都在无水体系里(甚至是熔融),常需酸催化脱水;但因胍基在酸性条件下主要以盐的形式存在,反应速率不快,需长时间回流,还要避免副产物。
注:可用羧酸酯同醇溶的游离胍基进行亲核反应,速率稍快,可以作为代替。
dtt用水溶解:DTTCI属于IR染料,它易溶于水和一些极性溶剂,你可以将它溶解在无水甲醇、无水乙醇这些质子溶剂里,也可以有限互溶于丙鲖、二氯甲烷和DMSO等非质子溶剂里。
DTT也常常被用于蛋白质中二硫键的还原,可用于阻止蛋白质中的半胱氨酸之间所形成的蛋白质分子内或分子间二硫键。
但DTT往往无法还原包埋于蛋白质结构内部(溶剂不可及)的二硫键,这类二硫键的还原常常需要先将蛋白质变性(高温加热或加入变性剂,如6M 盐酸胍、8M 尿素或1% SDS)。反之,根据DTT存在情况下,二硫键还原速度的不同,可以判断其包埋程度的深浅。
dtt还原性:
DTT是一种很强的还原剂,其还原性很大程度上是由于其氧化状态六元环(含二硫键)的构象稳定性。它的氧化还原电势在pH为7时为-0.33伏。
二硫苏糖醇对一个典型的二硫键的还原是由两步连续的巯基-二硫键交换反应所组成:其中,第一步反应所形成的中间态很不稳定,因为DTT上的第二个巯基趋向于与被氧化的硫原子连接,使中间态很快被转化为DTT的环状氧化结构,从而完成对二硫键的还原。
以上内容参考:百度百科-二硫苏糖醇
能使蛋白质沉淀的试剂书:浓盐酸和浓氢氧化钠溶液会使蛋白质变性。
蛋白质的沉淀剂有
加热,大部分蛋白质在温度超过60摄氏度以上会变性,沉淀。
盐析法沉淀:硫酸铵分级盐析法,蛋白质疏水集团暴露,沉淀。
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等电点沉淀法:配置磷酸盐缓冲液,tris盐酸缓冲液等,当pH为等电点时,蛋白质沉淀。
有机溶剂:丙酮和乙醚等,加乙醇也会有部分沉淀
表面活性剂,去垢剂等:SDS,Tween 100,Span 85等。
变性剂:盐酸胍等
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蛋白质沉淀,外文名precipitation,破坏蛋白质分子的水化作用或者减弱分子间同性相斥作用的因子,使蛋白质在水中的溶解度降低而沉降下来转化为固体的分离方法。
用于蛋白质沉淀操作的方法很多,如等电点沉淀、盐析、有机溶剂沉淀、加入非离子型聚合物沉淀。加入聚电解质沉淀等。
蛋白质沉淀定义
蛋白质的沉淀(protein precipitation),沉淀是溶液中的溶质由液相变成固相析出的过程。蛋白质从溶液中析出的现象,称为蛋白质的沉淀。蛋白质沉淀常用的方法有盐析、等电点沉淀、有机溶剂沉淀、生物碱试剂与某些酸(如三氯醋酸)沉淀等。
① 包涵体就是蛋白的变性聚集后的产物,6M盐酸胍及8M尿素是作为溶解包涵体的溶剂。
② 复性的过程是逐步去除盐酸胍或者尿素,从而使得蛋白天然构象逐步形成。
所以一般如果起始使用的是6M盐酸胍进行包涵体溶解,这个过程中逐步降低的是盐酸胍的浓度。
准备试剂:异丙醇含0.3M盐酸胍的95%乙醇无水乙醇1%SDS。
操作步骤:
1.取沉淀DNA后剩余的上清,用异丙醇沉淀蛋白质。每使用1ml
TRIzol加1.5ml异丙醇,室温放置10分钟,2~8℃12000×g离心10分钟弃上清。
2.用含0.3M盐酸胍的95%乙醇洗涤蛋白质沉淀。每使用1mlTRIzol加2ml洗涤液,室温放置20分钟,2~8℃7500×g离心5分钟,弃上清,重复两次。用2ml无水乙醇同样方法再洗一次。
3.真空抽干蛋白质沉淀5~10分钟,用1%SDS溶解蛋白质,反复吸打,50℃温浴使其完全溶解,不溶物2~8℃10000×g离心10分钟除去。分离得到的蛋白质样品可用于Western
Blot或-5至-20℃保存备用。
注意事项:
1.蛋白质沉淀可保存在含0.3M盐酸胍的95%乙醇或无水乙醇中2~8℃一个月以上或-5至-20℃一年以上。
2.用0.1%
SDS在2~8℃透析三次,10000×g离心10分钟取上清即可用于Western
Blot。
常见问题分析:
得率低:
A.样品裂解或匀浆处理不彻底。
B.最后得到的蛋白质沉淀未完全溶解。
蛋白质降解:组织取出后没有马上处理或冷冻。
电泳时条带变形:蛋白质沉淀洗涤不充分。
高温下热处理蛋清后蛋清凝固就是一种蛋白质变性的过程。高温条件下蛋白质分子中的氢键断裂,但其一级结构没有发生变化,蛋白的空间结构遭到破坏后,原来在蛋白内部的疏水基团暴露出来,发生疏水互作,蛋白的溶解度降低发生沉淀。
而8M的尿素为什么能重新溶解变性后的蛋清呢?
1、尿素在4M-8M时都能断裂氢键,是蛋白质发生不同程度的变性,因此尿素本身也是一种变性剂。但是高浓度尿素可以使蛋白完全变性,使蛋白以无规则卷曲的状态存在;
2、尿素具有形成氢键的能力,尿素在8M浓度下时,可以破坏水的氢键,降低疏水相互作用,使蛋白质分子内部暴露的疏水基团伸展和溶解性增加。
这一技术已经不新鲜了,实验室中常用的除了尿素还有盐酸胍,它们都是变性蛋白较好的溶解剂。在体外表达蛋白时,大肠杆菌由于缺少蛋白折叠辅助因子或者蛋白表达率过高来不及折叠,此时很容易形成非正常折叠的蛋白造成包涵体的出现。常见的纯化方法是将包涵体分离出来用尿素重新溶解包涵体蛋白后再复性蛋白质。
2)用沉淀跑电泳可以确定目的蛋白是否在包涵体?
包涵体是不溶于水的,比较总蛋白.沉淀,及上清中的诱导带就可以知道上清中有没有你想要的可溶蛋白了
3)电泳检测的话,可以用SDS-PAGE检测,在上样之前,需要用上样缓冲液处理样品,处理后,包涵体也就解聚了,每个蛋白分子与SDS结合,形成了可溶物.
4)质量大的话怎么可以用电泳来确定呢?
为什么不可以呢?DNA电泳,蛋白电泳不都可以吗?
5)电泳的原理就是根据蛋白质量大小来将不同的蛋白分开的呀?
不通种电泳的原理个不相同.SDS-PAGE可以简单的认为是根据蛋白质量来区分蛋白的.
你想不明白应该是不知道什么是包涵体,或者什么是电泳,电泳的原理,你自己还是在网上好好看看这些内容,应该不难理解.
上样缓冲液中有巯基乙醇,SDS,样品还要加热,破坏了包涵体之间蛋白的相互作用力,最好还是看看是怎么行成的包涵体吧