质粒DNA的小量制备 注意哪些操作 为什么
质粒DNA的小量制备注意事项:
如有必要,在酶切反应液中加人1 μl 10 mg/ml RNA酶溶液(不含DNA酶)以去除污染的RNA。
在使用前,在溶液Ⅳ(洗涤液)加入40ml无水乙醇,然后在瓶盖上作好记号。
溶液Ⅱ(lysis buffer)在温度较低时,可能会产生沉淀,需先用水浴加热溶解,混匀后再使用.溶液Ⅱ易被空气中的CO2酸化,用完后应立即盖紧瓶盖。
最后加水溶解质粒时,可先将水加热,提高溶解度。
质粒DNA的小量制备的步骤:
细菌的收获:将1.5ml菌液倒入微量离心管中,12000g离心30秒,吸去培养液。上清要务必吸取干净,否则会影响质粒的质量。必要时可以离心2次。
将细菌沉淀重悬于150μl用冰预冷的溶液I中,加入1/50体积RNAseA贮存液,剧烈振荡,使之完全分散。
溶液I:50mmol/L葡萄糖,25mmol/LTris&#8226Cl(pH8.0),10mmol/LEDTA(pH8.0)
不含dna酶的RNaseA:10mg/ml,TE配制,煮沸15~30min,-20℃分装贮存
注:(1)溶液I高压蒸气灭菌后,贮存于4℃;(2)葡萄糖可以由NaCl代替,以利于储存;但提取大于15kb的质粒,应将细菌悬于等渗蔗糖溶液中,并用溶菌酶处理;(3)务必使细菌沉淀完全分散,以利于碱液作用充分;(4)震荡时可以在离心管中加入牙签或枪头,提高效率;(5)配制RNaseA贮存液时,煮沸时间不宜过长或过短;(6)溶液I每2个月重新配制1次。
加200μl溶液Ⅱ,颠倒混匀。
溶液Ⅱ:0.2mol/LNaOH,1%SDS
注:(1)若菌体裂解得充分,则溶液会变得很粘稠;(2)不要剧烈震荡,否则会混入基因组DNA;(3)每2个月重新配制1次。
加150μl用冰预冷的溶液Ⅲ,轻微震荡混匀
溶液Ⅲ:5mol/L乙酸钾60ml,冰乙酸11.5ml,水28.5ml
注:(1)所配成的溶液对钾是3mol/L,对乙酸根是5mol/L,pH4.8左右;(2)尽量不要有大的块状沉淀,以利于下步离心;(3)每1个月重新配制1次,并分装贮存于小口瓶中。
12000g离心5分种,将上清转移到另一离心管中。
加入1/2体积的Tris饱和酚、1/2体积的氯仿-异戊醇(24:1)混合液,剧烈震荡混匀。
12000g离心5分种,将上层液体转移到另一离心管中。
注:为了保证不吸出下层液体,可以先离心30秒,然后将上层与少量下层液体吸至另一离心管,离心5分种,再转移上层液体。切勿混入下层液体。
加入60%体积的异丙醇,颠倒混匀后,室温静置5分钟。12000g离心5~10分钟,小心吸去上清液。
注:(1)沉淀即为质粒DNA;(2)为确保质粒完全沉淀,异丙醇的体积可以适当加大至62~65%。
0.8ml70%乙醇洗涤DNA沉淀后,小心地吸去上清。在空气中静置3~10分钟,待沉淀干燥后,溶解于50μl高压灭菌的水中。
注:为洗涤充分,可以洗2次。
取1~2μl样品测定紫外吸光度,对所得质粒进行定量并了解其纯度,或取1~2μl样品进行琼脂糖电泳,估计其纯度和得率。
碱裂解法是提取质粒的最常用也最有效的方法,是基于染色体DNA与质粒DNA的变性与复性的差异达到分离目的。
原理:高pH使质粒DNA和染色体DNA变性,同时沉淀蛋白质。再将pH值调至中性,质粒DNA较小,很容易复性成双链。而染色体DNA较大,不会复性,缠结成网状不溶物质,从而可以通过离心除去。
方法:依次加入下面三种溶液:
溶液1:
葡萄糖
50
mmol/L,EDTA
100
mmol/L,Tris-Cl
25
mmol/L,溶菌酶5mg/ml,pH
8.0
溶液2:
NaOH
0.2
mol/L,SDS
1%
溶液3:
5
mol/L
KAc
60
ml,冰乙酸
11.5
ml,重蒸水
28.5
ml
其中溶液1作用主要是悬浮菌体,溶液2作用是裂解菌体,释放胞内物质,溶液3是沉淀染色体DNA
一、实验目的
1、了解动物细胞染色体制片的原理。
2、学习蛙骨髓细胞染色体制片的方法。
3、观察蛙染色体的数目和形态。
二、实验原理
小型动物染色体制片最好、最有效的材料就是骨髓组织。在骨髓细胞中,有丝分裂指数相当高,可直接得到中期细胞。为提高有丝分裂指数,实验前,于动物腹腔内注射一定量的秋水仙素溶液,取骨髓后,经低渗处理、固定、滴片、空气干燥后即可获得良好的中期分裂相。
三、实验材料、
蛙类
四、器具及药品
注射器,离心管、解剖器、离心机,冰箱、电子天平,显微镜,搪瓷缸,载玻片,烧杯,滴管,秋水仙素,KCl,甲醇、冰乙酸,乙醇。
五、实验步骤
一离心法(适合于个体大的蛙)
1、前处理
目的:改变细胞质的粘度,抑制或破坏纺锤体的形成,使染色体缩短和分散,获得较多中期分裂相。
实验前8-20小时,将蛙称重,按每克体重10-40ug的剂量(无尾类10-20ug,有尾类30-40ug)经腹腔注射秋水仙素溶液,秋水仙素溶液浓度100-1000ug/ml,按蛙大小来配。
2、取骨髓细胞
将蛙麻醉,用手术剪剥开腹腔,取下四肢骨,剔净肌肉,放到盛有0.046mol/l的KCl的小烧杯中洗一下,用镊子夹出来,剪掉两端关节,将装有0.046mol/l的KCl的注射器从骨一头插入,冲骨髓细胞于干净的离心管内,反复冲洗几次,直到骨变白为止。注意这一过程不要让组织块掉入离心管。
3、低渗处理
目的:使细胞吸水膨胀,细胞膜易破裂,有助于染色体的分散。
当骨髓细胞全部冲入离心管后,开始计时,即低渗开始。室温下低渗处理30-40分钟,在此过程中,要用吸管反复吹打。
另外取预先洗净的载玻片放入盛有蒸馏水的搪瓷缸中,置冰箱中冰冻。
4、固定
目的:尽快杀死细胞,使细胞尽可能保持原有的状况,并且还可以去掉细胞质。
将离心管两两平衡后,对称放入离心机内,以1000转/分离心10分钟,轻轻取出,弃上清液,沿管壁缓慢加入现配卡诺氏固定液6ml左右,并用吸管吹散细胞团,固定30分钟,平衡后再离心,弃上清液,加卡诺氏固定液进行第二次固定。
注意,固定液要现配,每次离心前都要平衡,离心的时间、速度均同第一次。由于每离心一次,细胞要损失30%左右,因此对个体小的蛙第二次固定也可省去,但固定次数少,细胞质不易去掉,影响效果,固定次数多,离心后细胞损失多。这一茅盾的解决有待多次实验的摸索,原则上大型蛙可固定2-3次,小型蛙1次。