dna提取液25:24:1为什么会出现分层现象?
酚:氯仿:异戊醇试剂是由Tris饱和酚、氯仿和异戊醇按 25:24:1的体积比混合而成的,主要用于基因组 DNA的提取等试验。苯酚使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。氯仿抽提加速有机相与液相分层,去除核酸溶液中的迹量酚。异戊醇减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。使用酚:氯仿:异戊醇抽提离心后的上层为含DNA的水相、中间为变性蛋白相,下层为有机溶剂相。
静置后产品有分层现象,使用时将产品摇匀后用移液器吸取即可。本试剂有较强的腐蚀性,应尽量避免皮肤接触或吸入体内。如发现变为红色或棕色,表明已发生氧化,不能继续使用。
储存条件:4℃避光,有效期12个月。
酚:氯仿:的目的是沉淀蛋白质原理如下:酞与氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去,使蛋白失去水合状态而变性过离心,变性蛋白质的密度比水的密度为大,因而与分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA分开.水相异戊醇的目的是减少抽提过程中的泡沫产生,原理如下:在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用.加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生.
使用苯酚抽提细胞 DNA 时,苯酚的作用是使蛋白质变性,同时抑制了 DNase 的降解作用.用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与 DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶.蛋白分子溶于酚相,而 DNA 溶于水相.
氯仿的作用是克服酚的缺点;加速有机相与液相分层.最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚.(酚易溶于氯仿中)
用酚-氯仿抽提细胞基因组 DNA 时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?因为异戊醇可以减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡.异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡 产生.另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含 DNA 的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定.