溴酚蓝和二甲苯青先出加样孔的是谁
一个是溴酚蓝,一个二甲苯青,在琼脂糖浓度为1%-5%时,两者的电泳速度基本恒定。溴酚蓝的速度相当于300bp的条带,二甲苯青指示4000bp的条带。电泳时,看到一前一后的蓝带和青带既是这两个指示剂。
两条带分别代表溴酚蓝和二甲苯氰。在0.5xTBE为缓冲液,琼脂糖浓度低于2%的凝胶电泳中溴酚蓝迁移速率约与长300bp的线状双链DNA相同,而二甲苯氰约与长4000bp的DNA相同。
首先你要搞明白为什么要电泳,电泳的目的是什么.我不知道你有没有亲自做过电泳,首先希望你先查询下如何DNA电泳.在DNA电泳前,
在需要电泳的DNA溶液里加上loading
buffer,目的是在电泳时可以看到指示带,有两条:跑在前面的蓝色条带是溴酚蓝,位置大约相当于300bp的DNA,后面的绿色条带是二甲苯青FF,相当于4000bp左右大小DNA的位置.
2.在制备琼脂糖胶时,需要加入EB,EB可以与DNA结合,在紫外灯下显示DNA位置,也就是你说的白色条带.
3.现在有些实验室用一些新型染料(EB有毒),可以用蓝光而不是紫外观察条带,这个时候看到的DNA条带其实是淡蓝色的,不是白色的.
溴酚蓝在琼脂糖中的泳动速率约与长300bp的双链线状dna相同,而二甲苯青ff的泳动则与长4kb的双链线状dna相同。
希望能够对你有所帮助。
二苯胺和抗坏血酸显色后出现的就是同功酶的条带了,这是利用酶的催化作用产生的颜色,其他蛋白不会显示出来.
溴酚蓝指示的条带不水平,可能原因很多,比如胶聚合不均匀,电泳电压过大,样品或点样缓冲液有问题等等都有可能.
前面的蓝色的条带是溴酚蓝,代表的片段大小是 300bp,后面的有点绿色的条带是二甲苯青,代表的片段大小在4000bp左右。
loading buffer的功能主要有两个。第一,里边的指示剂溴酚蓝和二甲苯酚起到指示的作用,显示电泳的进程,以便我们适时终止电泳;第二,里边的成分甘油可以加大样品密度,使样品密度大于TAE,从而沉降到点样孔中,防止样品飘出点样孔。
只是用于指示作用,防止跑胶跑过了。一般跑电泳时,片段的大小很少小于300bp,大于4000bp,目的DNA片段的电泳迁移率介于两者之间,当前面的蓝色条带迁移到4/5的位置时就可以终止电泳了,蓝色条带在胶内,那么扩增的DNA片段一定还在胶内,其位置在蓝色条带的后面。
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3,3′,5,5′-四溴苯酚磺酞。一种pH 指示剂,在pH 3.0~4.6范围,颜色由黄变蓝。常用做电泳指示染料,凝胶中电泳迁移速度在小分子核酸或蛋白质区域。
中文名
溴酚蓝
英文名
Bromophenol blueAlbutest
别称
四溴苯酚磺酞
化学式
C19H10Br4O5S
分子量
670.02
CAS登录号
115-39-9
目录
1 基本信息
2 CAS编号
3 性状描述
4 物理参数
5 用途说明
6 贮藏运输
7 危险说明
8 配置方法
溴酚蓝基本信息
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【中文全称】3,3′,5,5′-四溴苯酚磺酰酞
【别名】 四溴苯酚磺酞
【英文名称】Bromophenol blueAlbutest
【英文别名】 3,3,5,5-TetrabromophenolsulfonephthaleinBPBTetrabromophenoltetrabromosulfonephthaleinBromophenol Blue (0.1% in water)Bromophenol blue solutionBromphenol Bluetetrabromophenolsulphonephthalein
【分子式】C19H10Br4O5S
【相对分子量或原子量】670.02
【性状】 从乙酸及丙酮混合液中析出者为长六角形棱柱状结晶。近似黄色或浅玫瑰色结晶性粉末,微溶于水及乙醚,溶于乙醇或稀碱液及氨液中呈蓝色。PH变色范围 3.0(黄)~4.6(蓝紫)
【溶解情况】 微溶于水,易溶于甲醇、乙醇和苯,可自由溶于氢氧化钠溶液,同时形成溴酚蓝钠盐水溶液。
【用途】 pH指示剂,pH=3.0时呈黄色,pH=4.6时呈蓝紫色。酸碱指示剂;非水滴定用指示剂,蛋白电泳染色;病毒化验等。
【制备或来源】 将苯酚磺酰酞悬浮于醋酸中,然后徐徐加入溴,并使溴过量,在搅拌下,于50℃进行反应而得。
【其他】 溴酚蓝分解温度279℃,在210℃绿色升华物退色为橙色。
溴酚蓝CAS编号
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CAS编号:115-39-9
溴酚蓝性状描述
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浅黄色到棕黄色粉末;易溶于氢氧化钠溶液,溶于甲醇、乙醇和苯,微溶于水(约0.4g/100ml);最大吸收波长422nm
溴酚蓝物理参数
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熔点:273℃(dec.)(lit.)
溴酚蓝用途说明
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配置溴酚蓝指示液。用途:变色范围:pH2.8-4.6(黄-蓝),酸碱指示剂;非水滴定用指示剂,蛋白电泳染色;病毒化验等。
溴酚蓝贮藏运输
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密封阴凉干燥保存
溴酚蓝危险说明
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安全等级:22-24/25
安全术语
S22Do not breathe dust.
切勿吸入粉尘。
S24/25Avoid contact with skin and eyes.
避免与皮肤和眼睛接触。
溴酚蓝配置方法
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方法1:1%的溴酚蓝
将托盘天平上称取1g溴酚蓝定溶于100ml无水乙醇中,转移入滴瓶中,贴标签备用。
方法2:0.05%的溴酚蓝
配western blot用的2*SDS上样缓冲液需要用到0.1%的溴酚蓝,2-DE中溴酚蓝一般也是配成0.1%母液。实际上,溴酚蓝在水中的溶解度不高,直接将0.1g溴酚蓝溶于100ml水是有困难的。下面是其较合适的配制方法:
0.05%的溴酚蓝配制方法:取溴酚蓝0.1g,加0.05mol/L氢氧化钠溶液3.0ml使溶解,再加水稀释至200ml,即得。 变色范围pH2.8~4.6(黄→蓝绿)。只是不知道加入NaOH会不会影响2-DE实验。估计影响不大,因为指示剂用量毕竟很少。
方法3:1%溴酚蓝
加1g水溶性钠型溴酚蓝于100ml水中,搅拌或涡旋混合直到完全溶解。溴酚蓝其钠盐易溶解在水里。