苯酚使蛋白质变性的机理是什么

苯酚、氯仿、异戊醇抽提DNA的原理是通过有机溶剂抽提，去除蛋白，多糖，酚类等杂质，再加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。

使用苯酚抽提细胞

DNA

时，苯酚的作用是使蛋白质变性，同时抑制了

DNase

的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与

DNA

联结键已断，蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相，而

DNA

溶于水相。

氯仿的作用是克服酚的缺点加速有机相与液相分层。

最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。

(酚易溶于氯仿中)

用酚-氯仿抽提细胞基因组

DNA

时，通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇，为什么?因为异戊醇可以减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力，从而减少气泡

产生。另外，异戊醇有助于分相，使离心后的上层含

DNA

的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。

苯酚/氯仿提取DNA是利用酚是蛋白质的变性剂，反复抽提，使蛋白质变性，SDS（十二烷基磺酸钠）将细胞膜裂解，在蛋白酶K、EDTA 的存在下消化蛋白质或多肽或小肽分子，核蛋白变性降解，使DNA从核蛋白中游离出来。

DNA易溶于水，不溶于有机溶剂。蛋白质分子表面带有亲水基团，也容易进行水合作用，并在表面形成一层水化层，使蛋白质分子能顺利地进入到水溶液中形成稳定的胶体溶液。当有机溶液存在时，蛋白质的这种胶体稳定性遭到破坏，变性沉淀。

离心后有机溶剂在试管底层（有机相），DNA存在于上层水相中，蛋白质则沉淀于两相之间。酚–氯仿抽提的作用是除去未消化的蛋白质。氯仿的作用是有助于水相与有机相分离和除去DNA溶液中的酚。抽提后的DNA溶液用2倍体积的无水乙醇在NaCl存在下沉淀DNA，回收DNA用70%乙醇洗去DNA沉淀中的盐，真空干燥，用TE缓冲液溶解DNA备用。

tris饱和酚酚可以抽提掉DNA中的蛋白，分层后上层tirs中含有DNA，而下层苯酚中含有蛋白。

水饱和酚可以抽提掉RNA中的蛋白质，分层后上层水相中含有RNA，而下层苯酚中含有蛋白。

苯酚是很强的蛋白质变性剂，所以溶于其中的蛋白都是变了性的蛋白。

苯酚通过使蛋白质变性而发挥作用。***************************蛋白质一苯酚复合物是一种疏松结合的复合物，*******************************所以，苯酚可以扩散渗进组织，该化合物具有显著的毒性作用，因其穿透性强，甚至可以影响无损的皮肤，将该药直接用于皮肤时，沉淀的蛋白质会形成一层白色的薄膜，这层薄膜很快变红，最后脱落，留下棕色的皮肤，如果苯酚继续接触皮肤，它会向深部穿透，从而可引起大面积坏死。

本实验采用的0.15mol/L 缓冲液系统可使大部分RNA-蛋白复合物解离，而DNA-蛋白复合物只有极少部分解离；用酚处理时DNA-蛋白复合物变性，在低温条件下从水相中除去，这样得到的RNA 制品中混杂的DNA 极少。用氯仿-异戊醇继续处理RNA 制品，可进一步除去其中少量的蛋白质。最后用乙醇使RNA 从水溶液中沉淀出来。本法得到的RNA 不仅纯度高，而且多呈自然状态，可供继续研究之用。

答：蛋白质对DNA制品的污染常常影响到以后的DNA操作过程，因此需要把蛋白质除去。一般采用苯酚/氯仿抽提的方法。苯酚、氯仿对蛋白质有极强的变性作用，而对DNA无影响。经苯酚/氯仿抽提后，蛋白质变性而被离心沉降到酚相与水相的界面，DNA则留在水相。

取ACD抗凝血2~3ml，置于15ml的离心管内----加灭菌生理盐水至10ml，颠倒混匀，3000rpm，离心10min-----弃上清，重复步骤2两至三次，直至上清呈无色或微红色----加压积红细胞5.5倍的溶血试剂，混匀，放置-20℃冷溶10min后移至4℃，30min，直至溶液由红色悬液变成红棕色清亮溶液-----3000rpm，离心15min，倒扣离心管于滤纸，使管壁液体流尽-----依次加入STE 450 ml，用枪头吹打混匀后，加入蛋白酶K至终浓度100mg/ml，然后加入10% SDS 25 ml，混匀后移至1.5ml EP管，放置于37℃水浴过夜或56℃，3h----加入等体积饱和酚（约500ml），漩涡振荡器上混匀至溶液呈乳滴状，13000rpm，离心5min。------取上清，加入500μl酚/氯仿（等体积配制混合液），漩涡振荡混匀，13000rpm，离心10min。---------取上清，加入500μl氯仿/异戊醇（24：1混合），漩涡振荡混匀，13000rpm，离心10min。-------取上清，加入50μl物NaAc（1/10体积），混匀后再加入1ml 冰冻的无水乙醇，颠倒轻摇，即可见絮状的DNA沉淀，13000rpm，离心10~20秒，得到DNA沉淀。------------DNA沉淀用70%乙醇洗2~3遍。--------待乙醇挥发后，DNA沉淀用100μl TE缓冲液溶解，核酸蛋白测定仪分析DNA浓度和纯度，-20℃保存备用。