酶切后的DNA可直接乙醇沉淀吗
可以,但是最好使用醋酸铵,也可以不加,回收效率可能会低一点,操作步骤:
方法一:
将忆确定的回收产物溶液于加有300 µL TE缓冲液的灭菌的1.5 mL Eppendorf管中。
加入等体积酚-氯仿-异戊醇,摇晃均匀。
12000 rpm离心5 min。
小心将水相移到另一1.5 mL Eppendorf管中,加入2.5~3倍体积(780 µL即可)预冷无水乙醇,以及10%水相体积的3 M NaAC(pH 5.2)。
置液氮3 min,取出后可置于-20℃放几min。小心防止管子爆裂。
12000 rpm离心10 min。
迅速弃上清,一般在管底会有针尖大小的沉淀物,小心用无水乙醇清洗后置于恒温器上干燥(55℃)5~10 min至无乙醇气味,再加入20 µL ddH2O溶解。
取20 µL电泳定量后-20℃储存备用。
方法二:
先把乙醇-20度预冷,酶切完后加入2倍体积的无水乙醇,-20度放置10min以上,12000rpm离心10min,管底出现白色沉淀,倒掉上清,换用70%乙醇重复一次,再用水溶解白色沉淀既可,损失率蛮大,回收率只有40%,或者更低。
乙醇沉淀的过程: 加入等体积的100%冷乙醇,加入1/10体积的NaAC(3M,pH5.2)后上下颠倒混匀, -20度30分钟,12000转4℃离心10分钟。倒掉上清,加入70%的冷乙醇,轻轻混匀,12000转4℃离心10分钟;倒掉上清,放在室温中干燥,标准是闻不到乙醇的味道,切记不要干燥过头。加入适当体积水或者TE缓冲液溶解。
1. 1/10 体积的乙酸钠(3 mol/L ,PH=5.2)充分混匀
2. 2 倍体积冰预冷的无水乙醇,混匀,- 20℃ 15~30 分钟;
3. 12,000 g X 10 min,弃上清;
4. 再加1ml 70%乙醇,12000g X 1 分钟,弃上清;
5. 挥发至干;
6. 加 ddH2O 或TE溶解 DNA 沉淀。
如果没有试剂盒也可以用等体积酚氯仿抽提,再加入十分之一体积3M
NaAc(pH5.2),2.5倍体积无水乙醇,-20度沉淀过夜,12000rmp离心后用70%乙醇洗涤后加TE溶解。
提取液中加入等体积预冷的5mol/L
Licl
充分混匀,1000rpm
4℃离心15min,取上清。
加等体积异丙醇,混匀,室温放置10min,10000rpm
4℃离心15min。
弃上清,纯点加入70%乙醇洗涤一次,沉淀风干10~15min。
500ul,含RNA酶的TE(pH8.0)溶解沉淀,室温放置30min。(将质粒RNaesA混合物用酚:氯仿抽提一次,然后用氯仿抽提一次)
用2.5倍体积无水乙醇沉淀质粒,风干10min。
加1ml灭菌水溶解沉淀,加500ul
PEG-MgCl2溶液,充分混合,室温10min,12000rpm
4℃离心15min。
用70%乙醇重悬沉淀,12000rpm
4℃离心15min。
弃上清,沉淀用70%乙醇处理一次,最后将质粒,溶于500ulTE(pH8.0)中,取1ul质粒DNA,100倍稀释后测OD260,计算DNA的浓度,其余封装,-20℃保存备用。