如何用乙醇沉淀法浓缩质粒DNA
用乙醇沉淀法浓缩质粒DNA:
提取液中加入等体积预冷的5mol/L
Licl
充分混匀,1000rpm
4℃离心15min,取上清。
加等体积异丙醇,混匀,室温放置10min,10000rpm
4℃离心15min。
弃上清,纯点加入70%乙醇洗涤一次,沉淀风干10~15min。
500ul,含RNA酶的TE(pH8.0)溶解沉淀,室温放置30min。(将质粒RNaesA混合物用酚:氯仿抽提一次,然后用氯仿抽提一次)
用2.5倍体积无水乙醇沉淀质粒,风干10min。
加1ml灭菌水溶解沉淀,加500ul
PEG-MgCl2溶液,充分混合,室温10min,12000rpm
4℃离心15min。
用70%乙醇重悬沉淀,12000rpm
4℃离心15min。
弃上清,沉淀用70%乙醇处理一次,最后将质粒,溶于500ulTE(pH8.0)中,取1ul质粒DNA,100倍稀释后测OD260,计算DNA的浓度,其余封装,-20℃保存备用。
在质粒DNA的制备中,无水乙醇起到沉淀DNA继而达到浓缩DNA的目的,70%的乙醇是用来洗涤DNA的,进一步去除杂质。
在除去蛋白质沉淀后,要加入无水乙醇使质粒沉淀,离心除去上清,再加入70%乙醇清洗DNA沉淀,清洗两次左右。最后要把DNA沉淀溶于TE或ddH2O中。
扩展资料:
1、 测量DNA溶液的体积,按lg/ml的用量精确地加入固体CsCl, 将溶液加温至30℃助溶。温和地混匀溶液直到盐溶解。
2、 每10mlDNA溶液加入0.8ml溴化乙锭溶液(10mg/ml溶于水);立即将溴化乙锭溶液(漂浮在表层)与DNA-氯化铯溶液混匀, 溶液的终密度应为1.55g/ml(溶液的折射率为1.3860)溴化乙锭浓度大约740μg/ml。【溴化乙锭贮存液应贮存于避光容器内(如用锡箔完全包裹的瓶子),于室温保存。
参考资料来源:百度百科-质粒DNA纯化
1. 1/10 体积的乙酸钠(3 mol/L ,PH=5.2)充分混匀
2. 2 倍体积冰预冷的无水乙醇,混匀,- 20℃ 15~30 分钟;
3. 12,000 g X 10 min,弃上清;
4. 再加1ml 70%乙醇,12000g X 1 分钟,弃上清;
5. 挥发至干;
6. 加 ddH2O 或TE溶解 DNA 沉淀。
异丙醇沉淀以后不必用70%乙醇洗.只有醋酸钠 乙醇沉淀之后才需要70%乙醇洗,目的是洗去加入的盐,乙醇浓度太高达不到脱盐效果,浓度太低DNA会溶掉
异丙醇沉淀以后有人用无水乙醇洗一遍,目的是加速DNA的干燥,因为异丙醇的挥发性没有乙醇好
主要目的还是为了除盐,前面沉淀DNA时加入的盐会影响你后续的克隆操作,如酶切和PCR.
无水乙醇沉淀DNA需要阳离子如Na离子的存在,而且需要1/1O体积的NAAC,并且加2倍体积的无水乙醇,而且沉淀的盐少,易挥发除去。缺点是总体积较大。需在-20放置很长时间,30分钟-1小时。同样需要70%乙醇洗涤。
我个人认为无水乙醇沉淀DNA的效果更好些,DNA在体积较大的条件下可以沉淀的更充分,提取的DNA含的盐离子也很好,而且乙醇也容易挥发去除,纯度相对来说也较好。
两者都适合沉淀线形和闭环的DNA或质粒,因为两者化学性质都是醇类,沉淀原理是相似。
如果你的DNA含量丰富的话,沉淀10min 就足够了,如果含量低,则需要在-20度沉淀30min-2小时。可以不短观察沉淀的量决定沉淀时间。
2021年8月26日效果一点也不差。 2) 抽提质粒时,用无水乙醇沉淀的时间可以由实验操作者来决定,如果时间充裕可以 30 min,否则 8-10 min 也可以
1.为什么用无水乙醇沉淀DNA?
用无水乙醇沉淀DNA,这是实验中最常用的沉淀DNA的方法。乙醇的优点是可以任意比和水相混溶,乙醇与核酸不会起任何化学反应,对DNA很安全,因此是理想的沉淀剂。
DNA溶液是DNA以水合状态稳定存在,当加入乙醇时,乙醇会夺去DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚合。一般实验中,是加2倍体积的无水乙醇与DNA相混合,其乙醇的最终含量占67%左右。因而也可改用95%乙醇来替代无水乙醇(因为无水乙醇的价格远远比95%乙醇昂贵)。但是加95%的乙醇使总体积增大,而DNA在溶液中有一定程度的溶解,因而DNA损失也增大,尤其用多次乙醇沉淀时,就会影响收得率。折中的做法是初次沉淀DNA时可用95%乙醇代替无水乙酵,最后的沉淀步骤要使用无水乙醇。也可以用0.6倍体积的异丙醇选择性沉淀DNA。一般在室温下放置15-30分钟即可。
2.在用乙醇沉淀DNA时,为什么一定要加NaAc或NaCl至最终浓度达0.1~0.25mol/L?
在pH为8左右的溶液中,DNA分子是带负电荷的,加一定浓度的NaAc或NaCl,使Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,易于互相聚合而形成DNA钠盐沉淀,当加入的盐溶液浓度太低时,只有部分DNA形成DNA钠盐而聚合,这样就造成DNA沉淀不完全,当加入的盐溶液浓度太高时,其效果也不好。在沉淀的DNA中,由于过多的盐杂质存在,影响DNA的酶切等反应,必须要进行洗涤或重沉淀。