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化学品巯基乙醇对有害吗谢谢请求

糊涂的发卡
大方的山水
2022-12-30 01:00:50

化学品巯基乙醇对有害吗谢谢请求

最佳答案
精明的八宝粥
体贴的大树
2026-05-02 00:56:13

主要用途:用于合成树脂及用作杀霉菌剂、杀虫剂、增塑剂、水溶性还原剂等。其它理化性质:1.4996健康危害:吸入、摄入或经皮肤吸收后会中毒。中毒表现有紫绀、呕吐、震颤、头痛、惊厥、昏迷,甚至死亡。对眼、皮肤有强烈刺激性。可引起角膜混浊。环境危害:对环境有危害,对水体可造成污染。燃爆危险:本品可燃,有毒。危险特性:遇高热、明火或与氧化剂接触,有引起燃烧的危险。受高热分解放出有毒的气体。加入保护剂防止某些生物活性物质的活性基团及酶的活性中心受到破坏。如最常见的巯基,是许多活性物质和酶催化的活性基团,极易被氧化,故提取时常加入一些还原剂。一些易受重金属离子抑制生理活性的物质,加入某些金属螯合剂,把有害金属离子螯和掉,而保持被提取物的活性。[螯合剂和巯基试剂]巯基试剂在生化反应中有两个用途,一是防止蛋白质或酶等分子中的SH-基氧化成S-S,二是某些酶反应中维持体系的还原环境。经常应用的巯基试剂有二硫丁醇类化合物(如二硫苏糖醇DTT、二硫赤酰糖醇DTE)和2-巯基乙醇,谷胱甘肽也经常应用。一般来说二硫丁醇类是常选用的巯基试剂,不仅是因为挥发性低,难闻的气味较少,而且氧化电位低,比2-巯基乙醇浓度低很多的情况下,可以使其他二硫化合物完全还原。螯合剂用于控制反应中金属离子浓度或去除金属离子,常用的螯合剂有EDTA(乙二胺四乙酸)、EGTA、1,10-二氮杂菲、柠檬酸和磷酸等。抗氧化。用PBS配成100X的浓度,4度避光保存,用2周。瓶子上没有特殊标注,应该就是纯的吧?

最新回答
刻苦的羊
自信的微笑
2026-05-02 00:56:13

可以的。

DTT和2-ME(2-mercaptoethanol的简称,下同)都属于巯基试剂。

也就是说DTT和2-ME的作用是一样的:可以防止蛋白质或酶等分子中的巯基氧化成二硫键,维持体系的还原性环境。

β-巯基乙醇和DTT都是还原剂,防止蛋白质被氧化,β-巯基乙醇常用浓度为5-20MMOL/L,DTT为0.5-1MMOL/L。因为β-巯基乙醇加入缓冲液后24小时易被氧化,其后加速蛋白质的失活,而DTT氧化后形成稳定的分子内二硫健,并不危及蛋白的巯基,所以在蛋白制备中常用β-巯基乙醇,而长期储存用DTT。还有其上提到的试剂浓度均指终浓度。

至于使用浓度,DTT和2-ME的工作浓度一般为1-5mM,如果2-ME的浓度是1mM,由于DTT的氧化能力强于2-ME,DTT的浓度用0.5-1mM就可以了。

动人的楼房
时尚的黑猫
2026-05-02 00:56:13
total:10ml 4度下保存:

1mol/l Tirs-HCl(PH8.8) 0.6ml

10%SDS 2ml

50%甘油 5ml

2-巯基乙醇 0.5ml

1%溴酚兰 1ml

水 0.9ml

另外:SDS不好溶解建议加热溶解,如果要做非还原SDS-PAGE请将2-巯基乙醇 0.5ml换成超纯水即可

独特的老师
轻松的康乃馨
2026-05-02 00:56:13
答:

重金属盐,前述核糖核酸酶四二硫键及其氢键,变化程没化键断裂,看作化变化,三级结构与二硫键,发变性,般认蛋白质变性本质级键,所物理变化,变性程化键断裂,尿素;化素强酸、超声波作用等、紫外线照射,使蛋白质变性.蛋白质变性复杂.般认蛋白质二级结构三级结构改变或遭破坏,物性几乎全部恢复.蛋白质严密结构某些物理或化素作用,要视具体情况定.能使蛋白质变性化加强酸、振荡,提供自羟基或羰基氢或氧形氢键、搅拌让蛋白质变性蛋白质变性既物理变化;肽链间互相扭曲折叠起构特定形状排列称三级结构.临床医、乙醇,二硫键破坏,重金属阳离蛋白质游离羧基形溶性盐,化变化,剧烈振荡等、强碱使蛋白质变性;没化键断裂物理变化,失物性,没新物质尘:蛋白质由种氨基酸通肽键构高化合物?巯基乙醇,变化程没化键断裂,激素丧失性称蛋白质变性作用(denaturation).变性蛋白质蛋白质明显区别溶解度降低,注意防止蛋白质变性能效保存蛋白质制剂,蛋白质变性既物理变化,鸡蛋煮熟蛋白质,主要破坏厂蛋白质氢键,些称蛋白质二级结构,蛋白质各氨基酸结合顺序称级结构,其特定空间结构破坏.反.变性蛋白质空间构象破坏.氢键化键,强酸、强碱,结晶性破坏.重金属盐使蛋白质变性,化变化、尿素、紫外线照射.否则,化变化,蛋白质仍能恢复或部恢复其原构象及功能,改变其内部结构性质作用、脱水.物理素加热.游离氨基或羧基形盐.变性并非逆变化,易蛋白酶解,物性丧失;能使蛋白质变性物理加热.析看,变性程度较轻,并涉及级结构变化,称变性核糖核酸酶复性.β,强碱.化键断裂化变化,酶蛋白恢复其原构象、加压,剧烈振荡等物理使蛋白质变性:蛋白质同肽链氨基酰基间形氢键?巯基乙醇8M尿素作用,β,同蛋白质粘度增加,使肽链具定构象,变性逆变化称复性,,酶失催化力、强碱使蛋白质氢键断裂.加热,变化程化键断裂,都变性结,导致理化性质改变物性丧失.例,变性素应用于消毒及灭菌,并设使疏基氧化二硫键,氢键等联系着,重金属盐,要判断变性物理变化化变化、丙酮等,物理变化.强酸,乙醇,除变性素,变性经透析除尿素,紫外线照射,丙酮等.尿素、十二烷基磺酸钠(SDS)等,破坏蛋白质原氢键.引起蛋白质变性原物理化素两类.变性作用蛋白质受物理或化素影响

爱撒娇的白猫
热情的朋友
2026-05-02 00:56:13

晚上好,巯基化合物在PH弱酸性的缓冲条件下具有较强的对重金属阳离子螯合能力,它和EDTA、有机膦酸相似,对铜离子有配位作用请酌情参考。巯基乙醇在Tris中效果较好,在PBS中几乎丧失螯合能力的(巯基乙醇对碱性如锂、钠和钾以及两性金属化合物如锌、铝和铅等离子效果很差,对铜、镉、镍、银和汞等重金属随分子量增大螯合配位效力越来越强)。

强健的帆布鞋
危机的哈密瓜
2026-05-02 00:56:13
蛋白质提取方法-------列举10种方法一、植物组织蛋白质提取方法(summer)1、根据样品重量(1g样品加入3.5ml提取液,可根据材料不同适当加入),准备提取液放在冰上。2、把样品放在研钵中用液氮研磨,研磨后加入提取液中在冰上静置(3-4小时)。3、用离心机离心8000rpm40min4℃或11100rpm20min4℃4、提取上清夜,样品制备完成。蛋白质提取液:300ml1、1Mtris-HCl(PH8)45ml2、甘油(Glycerol)75ml3、聚乙烯吡咯烷酮(Polyvinylpolypyrrordone)6g这种方法针对SDS-PAGE,垂直板电泳!二、植物组织蛋白质提取方法(summer)三氯醋酸—丙酮沉淀法1、在液氮中研磨叶片2、加入样品体积3倍的提取液在-20℃的条件下过夜,然后离心(4℃8000rpm以上1小时)弃上清。3、加入等体积的冰浴丙酮(含0.07%的β-巯基乙醇),摇匀后离心(4℃8000rpm以上1小时),然后真空干燥沉淀,备用。4、上样前加入裂解液,室温放置30分钟,使蛋白充分溶于裂解液中,然后离心(15℃8000rpm以上1小时或更长时间以没有沉淀为标准),可临时保存在4℃待用。5、用Brandford法定量蛋白,然后可分装放入-80℃备用。药品:提取液:含10%TCA和0.07%的β-巯基乙醇的丙酮裂解液:2.7g尿素0.2gCHAPS溶于3ml灭菌的去离子水中(终体积为5ml),使用前再加入1M的DTT65ul/ml。这种方法针对双向电泳,杂质少,离子浓度小的特点!当然单向电泳也同样适用,只是电泳的条带会减少!三、组织:肠黏膜(newinbio)目的:WESTERNBLOT检测凋亡相关蛋白的表达应用TRIPURE提取蛋白质步骤:含蛋白质上清液中加入异丙醇:(1.5ml每1mlTRIPURE用量)倒转混匀,置室温10min离心:12000g,10min,4度,弃上清加入0.3M盐酸胍/95%乙醇:(2ml每1mlTRIPURE用量)振荡,置室温20min离心:7500g,5min,4度,弃上清重复0.3M盐酸胍/95%乙醇步2次沉淀中加入100%乙醇2ml充分振荡混匀,置室温20min离心:7500g,5min,4度,弃上清吹干沉淀1%SDS溶解沉淀离心:10000g,10min,4度取上清-20度保存(或可直接用于WESTERNBLOT)存在的问题:加入1%SDS后沉淀不溶解,还是很大的一块,4度离心后又多了白色沉定,SDS结晶?测浓度,含量才1mg/ml左右。解决:提蛋白试剂盒,另外组织大小适中,要碎,立即加2XBUFFER,然后煮5-10分钟,效果很好的。四、lysissolution:(yog)Proteinextractionbuffer(Camiolobuffer):100ml=(0.075MPotassiumAcetate)0.736g(0.3M)NaCl1.753g(0.1M)L-argininebasicsalt1.742g(0.01M)EDTA-HCl0.292g(0.25%)TritonX-100250.ulupto100mlwithdH20.pH7.4.Then0.2umfilter.1.Freezetissueinliquidnitrogen.2.RinseinPBSthenmince.3.Add1mlCamioloextractionbufferper100mgoftissue.4.Homogenizefor1minuteat4\\'C.5.Spinat3,000.rpm/15minutes/4\\'C.6.Removesupernatantandsaveinanothertube.7.Ifnecessary,dializethesupernatantagainstPBSwith50mM/LTris-HClpH7.4.五、植物材料:水稻苗,叶鞘,根(ynibcas)1、200毫克样品置于冰上磨碎2、加lysisbuffer,离心,10000rpm,4度,5min取上清3、重复离心5minlysisbuffer:ureanp-40ampholine2-mepvp-40六、蛋白质样品制备(sigma)秧苗蛋白质样品的提取按Davermal等(1986)的方法进行。100mg材料剪碎后加入10mgPVP-40(聚乙烯吡咯烷酮)及少量石英砂,用液氮研磨成粉,加入1.5ml10%三氯乙酸(丙酮配制,含10mM即0.07%β-巯基乙醇),混匀,-20℃沉淀1小时,4℃,15000r/min离心15min,弃上清,沉淀复溶于1.5ml冷丙酮(含10mMβ-巯基乙醇),再于-20℃沉淀1小时,同上离心弃上清,(有必要再用80%丙酮(含10mMβ-巯基乙醇所得沉淀低温冷冻真空抽干。按每mg干粉加入20μl(可调)UKS液[9.5M尿素,5mM碳酸钾,1.25%SDS,0.5%DTT(二硫苏糖醇),2%Ampholine(AmershamPharmaciaBiotechInc,pH3.5-10),6%TritonX-100],37℃温育30min,期间搅动几次,28度(温度低,高浓度的尿素会让溶液结冰)16000r/min离心15min,离心力越大时间长一点越好!上清即可上样电泳。或者-70度保存七、植物根中蛋白质的抽取(phenol)(1)sample,液氮研磨(2)装1.5mlcentrifuge用tube(3)加1MKH2PO4+K2HPO4700ul(4)12000rpm,4度,10-15minite(5)取上层液,蛋白质就在里面八、SDSextractionfollowedbyacetoneprecipitation–simpleextractionprotocolthatdoesnotrequirephenol.Recommendedstartprotocolforwholetissueextractions.(hgp)1.Grind1goffreshtissuetoapowderwithliquidnitrogeninamortarandpestle.2.Add5mLofextractionmedia(0.175MTris-HCl,pH8.8,5%SDS,15%glycerol,0.3MDTT)directlytomortarandcontinuegrindingforanadditional30sec.3.Filterhomogenatethroughtwolayersofmiraclothintoa50mLFalcontubeatroomtemperature.4.Immediatelyadd4volumesoficecold100%acetonetofilteredhomogenate,mixbyvortexingandplaceat-20Cforatleastonehourtoprecipitateproteins.5.Centrifugeat5000gfor15mintocollectprecipitatedprotein,decantsupernatant.6.GentlyblotresidualacetonefromcontainerwithKimwipeandthenwashpelletin15-20mLofcold80%acetone.Besuretothoroughlybreak-uppelletbypipetting,vortexingorsonication.7.Repeatsteps5and6.8.Collectfinalproteinprecipitatebycentrifugationat5000gfor15minanddrypelletbyinvertingonKimwipefor15minat37C.9.Resuspendfinalpelletin0.5-1mLofIEFextractionsolution(8Murea,2Mthiourea,2%CHAPS,2%TritonX-100,50mMDTT,0.2%pH3-10ampholytes)bypipettingandvortexingat25-30C.Incubatesamplefor1hatroomtemperaturewithagitation.Donotheatsampleunderanycircumstancesasthiswillleadtocarbamylationofproteins.10.Centrifugefor10minat12000gandusesupernatanttorehydrateIPGstrips.11.Ifproteinquantitationisnecessary,precipitateproteinsamplewithTCAoracetonepriortoperformingBradfordorLowryassayasdetergentsandreducingagentsinterferewiththeseassays.Phenolextractionfollowedbymethanolicammoniumacetateprecipitation–aneffectiveprotocolforsamplepreparationfromprotein-poor,recalcitranttissuessuchasplants(seeHurkmanandTanaka,1986,PlantPhysiology81:802-80九、材料:细菌蛋白(puc18)用甲醇提取的,冻干后用缓冲液溶解的。样品缓冲液是一般的。其中含又2%的SDS,20mmol的2-巯基乙醇。十、线粒体蛋白的提取(bioon)IsolationforMitochondriaModificationbyBioonMaterialsandreagents:homogenizingbuffer:100mMmannitol10mMTris-HClbuffer(pH7.5)5mMMgCl2关于蛋白质1mMEGTA1mMDTTleupeptin(0.1ug/ml)0.1MNa2CO3Methods:-10*6Cellswerewashedwithice-coldPBSandlysedbyhomogenizingin1mlbuffer(ice-cold)containing100mMmannitol,10mMTris,5mMMgCl2,1mMEGTA,1mMDTT,leupeptin(0.1ug/ml)-SubjectedtoPolytronhomogenizationforthree-fourburstsof3-10seachatasettingof6.5.-Intactcellsandnucleiwereseparatedbycentrifugationat120gfor5minat4℃-Supernatantswerecentrifugedat10,000gfor10mintocollecttheheavy(mitochondrial)membranepellet.-Cytoplasmicfractionswereobtainedbycentrifugingsupernatantsat100,000gfor30min.-Resuspendedpelletto0.25mg/mlinfreshpreparationof0.1MNa2CO3(pH11.5)-Incubatedonicefor30min.-Ultracentrifugationat100000gfor1hat4℃toprecipitatethemitochondriamembraneprotein.Andthesupernatantsaremitochondrialmatrix.0.5mgofproteinsinmitochondriacanget100ugofproteins(thealkali-resistantfractions)Ref.:PNAS,2002,99:12825–12830本方法只适用于提大鼠细胞线粒体蛋白,而不适用于线粒体功能检测

酷酷的黑米
等待的唇彩
2026-05-02 00:56:13
通过变性剂破碎细胞或者组织,然后经过氯仿等有机溶剂抽提RNA,再经过沉淀,洗涤,晾干,最后溶解。但是由于RNA酶无处不在,随时可能将RNA降解,所以实验中有很多地方需要注意,稍有疏忽就会前功尽弃。0T3z(F&_,D6c%^"h6YA6_RNA提取的一般步骤-O:Y+x$p#s8U4M9S所有RNA的提取过程中都有五个关键点,即:样品细胞或组织的有效破碎;有效地使核蛋白复合体变性;对内源RNA酶的有效抑制;有效地将RNA从DNA和蛋白混合物中分离;对于多糖含量高的样品还牵涉到多糖杂质的有效除去。但其中最关键的是抑制RNA酶活性。RNA的提取目前阶段主要可采用两种途径:提取总核酸,再用氯化锂将RNA沉淀出来;直接在酸性条件下抽提,酸性下DNA与蛋白质进入有机相而RNA留在水相。第一种提取方法将导致小分子量RNA的丢失,目前该方法的使用频率已很低。(O(g^+K)f+i&]%P实验步骤:*l&d6s5e(q1F(g2|j,^0s破碎组织→分离RNA→沉淀RNA→洗涤RNA→融解RNA→保存RNA。6D8}.QY,g*X1、破碎组织和灭活RNA酶可以同步进行,可以用盐酸胍、硫氰酸胍、NP-40、SDS、蛋白酶K等破碎组织,加入β-ME可以抑制RNA酶活性。"s%f,`0[1d*m!]0e2、分离RNA一般用酚、氯仿等有机溶剂,加入少量异戊醇,经过此步,离心,RNA一般分布于上层,与蛋白层分开。&X.P)i)YL#u/[3、沉淀RNA一般用乙醇、3MNaAc(pH-5.2)或异丙醇。2@0d&z7?+i,g1@4、洗涤RNA使用70%乙醇洗涤,有时,为避免RNA被洗掉,此步可以省掉,洗涤之后可以晾干或者烤干乙醇,但是不能过于干燥,否则不易溶解。3@%V"o9v+I1J2o9k"z5、融解RNA一般使用TE。L5f.n6}(S1t%Z&J6、保存RNA应该尽量低温。为了防止痕量RNase的污染,从富含RNase的样品(如胰脏、肝脏)中分离到的RNA需要贮存在甲醛中以保存高质量的RNA,对于长期贮存更是如此。从大鼠肝脏中提取的RNA,在水中贮存一个星期就基本降解了,而从大鼠脾脏中提取的RNA,在水中保存3年仍保持稳定。另外,长度大于4kb的转录本对于痕量RNase的降解比小转录本更敏感。为了增加贮存RNA样品的稳定性,可以将RNA溶解在去离子的甲酰胺中,存于-70℃。用于保存RNA的甲酰胺一定不能含有降解RNA的杂物。来源于胰脏的RNA至少可以在甲酰胺中保存一年。当准备使用RNA时,可以使用下列方法沉淀RNA:加入NaAc至0.3M,12,000×g离心5分钟。&P3[7m*^$U$_"?:F"xu*N(?(I氯化锂法提取总RNA:"u}'I!r'^'^&l本方法用高浓度尿素变性蛋白并抑制RNA酶,用氯化锂选择沉淀RNA,其特别适合于从大量样品中提取少量组织RNA,具有快速简洁的长处,但也存在少量DNA的污染及RNA得率不高,小RNA片断丢失的缺陷。#~*S:}9`*r4Z3P试验试剂:"d$r6Q+_.I8Q1、氯化锂/尿素溶液【氯化锂126g(3M)尿素、360g(6M)加水至1L,过滤灭菌】7_8w1t"o9a'q!i4Z2、悬浮液【10mM?Tris-HCL(pH7.6),1mM?EDTA(pH8,0),0.5%SDS】!m8Q4R,]&y:b#`7d试验步骤:7[6?$`*}o7_Z'{1、对于大量组织或细胞,则每克组织或细胞加入5-10ml氯化锂-尿素溶液,匀桨器高速匀桨2分钟;对于少量细胞(107个细胞/ml),则每克组织或细胞加入0.5ml氯化锂-尿素溶液手工匀桨,并转移至Eppendof管中。&Y)b:E,Q"l/^Q:\$s2、匀桨液在0-4℃放置4小时后,12000g离心30分钟。x-C6D-N/N0K!t2a3、取沉淀,加入原匀桨液1/2体积的氯化锂-尿素溶液,重复步骤2。)y-x)S0K9y6j,e4、沉淀用原匀桨液1/2体积的氯化锂-尿素溶液复溶后,加入等体积酚/氯仿/异戊醇在室温放置15-30分钟并不时摇动混匀,4000g离心5分钟。3d2v'i1~(~*D5、取上层水相,加1/10倍体积的3M乙酸钠(pH5.2)及2倍体积的乙醇,-20℃放置1小时,5000g离心。L4a'Q4u"l:a*K%Z$?(e6、70%乙醇洗沉淀一次。真空干燥。3}r0[/Q'G9q7、RNA溶解液溶解沉淀,得RNA,分装,于-70℃保存。0f.X%R(H%B7g!y7j5u$C'|)[%~!J3D:Q蛋白酶-热酚法6|"^0b*[)P3S*c4b4H4l本方法适合于病毒RNA的提取*I(i+b#r!K试验试剂:$?4[7H9`)J1、蛋白酶K(终浓度50ug/ml),J5pl6V/t7[/I2、2×缓冲液:1%SDS?20mMTris-HCL(pH7.6)?0.2MnaCL9h,p]y+\$Z)O试验步骤:#W3v8G1[$]5y1、提纯病毒液中加入等体积缓冲液、蛋白酶K,37℃40-50分钟。-K0p/E'G0M#Q-z7n,{#d2、加入等体积65℃预热的酚溶液,轻徭,在65℃保温5分钟后再轻徭。w!`W(~,E:i3^3、离心,取上清,氯仿抽提一次。,|(Z0dj2@7m+d2Q&xH4、取上层水相,加1/10倍体积的3M乙酸钠(pH5.2)及2倍体积的乙醇,-20℃放置1小时,5000g离心(10000g,10min)。7[/w,h2d6U$k5、70%乙醇洗沉淀一次。真空干燥。%A5Y{(w%]3a*y,Oe)P6、RNA溶解液溶解沉淀,得RNA,分装,于-70℃保存。植物RNA提取过程中难点的相应对策植物RNA提取过程中难点的相应对策)o5B7d/Q3_酚类化合物的干扰及对策:a9D*Z3K?7W许多植物组织特别是植物的果实(如苹果、樱桃、李子、葡萄等)和树木类植物中富含酚类化合物。酚类物质的含量会随着植物的生长而增加。因而从幼嫩的植物材料中更容易提取RNA。此外,针叶类植物的针叶中多酚的含量比在落叶植物的叶子中要高得多。在植物材料匀浆时,酚类物质会释放出来,氧化后使匀浆液变为褐色,并随氧化程度的增加而加深,这一现象被称为褐化效应(browningeffect)。被氧化的酚类化合物(如醌类)能与RNA稳定地结合,从而影响RNA的分离纯化。但Newbury等发现RNA提取的难易程度与材料中酚类物质的总量之间并无相关性,因此认为不是所有的酚类化合物都影响RNA的提取。但一般认为所谓的“缩合鞣质”即聚合多羟基黄酮醇类物质(如原花色素类物质)是影响RNA提取的一类化合物。目前去除酚类化合物的一般途径是在提取的初始阶段防止其被氧化,然后再将其与RNA分开。9b0S!}0U6|9k/l!v"vg1~/@防止酚类化合物被氧化的方法:"vy,a4k7n/Z1、还原剂法:一般在提取缓冲液中加入(-巯基乙醇、二硫苏糖醇(DTT)或半胱氨酸来防止酚类物质被氧化,有时提取液中(-巯基乙醇的浓度可高达2%。(-巯基乙醇等还可以打断多酚氧化酶的二硫键而使之失活。Su等认为在过夜沉淀RNA时加入(-巯基乙醇(终浓度1%)可以防止在此过程中酚类化合物的氧化。硼氢化钠(NaBH4)是一种可还原醌的还原剂,用它处理后提取缓冲液的褐色可被消减,醌类化合物可被还原成多酚化合物。&H.z.p+~&t%t5G&G1M-P/q!u2、螯合剂法:螯合剂聚乙烯吡咯烷酮(PVP)和聚乙烯聚吡咯烷酮(PVPP)中的CO-N=基有很强的结合多酚化合物的能力,其结合能力随着多酚化合物中芳环羟基数量的增加而加强。原花色素类物质中含有许多芳环上的羟基,因而可以与PVP或不溶性的PVPP形成稳定的复合物,使原花色素类物质不能成为多酚氧化酶的底物而被氧化,并可以在以后的抽提步骤中被除去。用PVP去除多酚时pH值是一个重要的影响因素,在pH8.0以上时PVP结合多酚的能力会迅速降低〔11〕。当原花色素类物质量较大时,单独使用PVPP无法去除所有的这类化合物,因而需要与其它方法结合使用。p%N0w/t7r3、Tris-硼酸法:如果提取缓冲液中含有Tris-硼酸(pH7.5),其中的硼酸可以与酚类化合物依*氢键形成复合物,从而抑制了酚类物质的氧化及其与RNA的结合。这一方法十分有效,所以Lбpez-Gбmez等在提取缓冲液中不再加入其它还原剂。但如果Tris-硼酸浓度过高(>0.2M)则会影响RNA的回收率。#p8]0^8K3a4、牛血清白蛋白(BSA)法:原花色素类物质与BSA间可产生类似于抗原-抗体间的相互作用,形成可溶性的或不溶性的复合物,减小了原花色素类物质与RNA结合的机会,因此提高了RNA的产量。BSA与PVPP结合使用提取效果会更好。由于BSA中往往含有RNase,因而在使用时要加入肝素以抑制RNase的活性。)~#H/y(P7Q)j4G*w1G8l5、丙酮法:Schneiderbauer等用-70℃的丙酮抽提冷冻研磨后的植物材料,可以有效地从云杉、松树、山毛榉等富含酚类化合物的植物材料中分离到高质量的RNA。@+?-X/V9z8T8H:B3C!W'C酚类化合物的去除:&z#h)G0H&]$I1N"f.l9N通过Li+或Ca2+沉淀RNA的方法可以将未被氧化的酚类化合物去除。与PVP、不溶性PVPP或BSA结合的多酚,可以直接通过离心去除掉,或在苯酚、氯仿抽提时除去。Manning利用高浓度的2-丁氧乙醇(50%)来沉淀RNA,而多酚溶解于2-丁氧乙醇中而被除去。然后用含50%2-丁氧乙醇的缓冲液洗涤RNA沉淀以去除残留的多酚。他认为即使多酚被氧化,其氧化产物仍可以溶解在高浓度2-丁氧乙醇溶液中而被去除,无需再用NaBH4来处理。5C6Y8a1SV:`2~多糖的干扰及对策:6I-b3R4~$T&O多糖的污染是提取植物RNA时常遇到的另一个棘手的问题。植物组织中往往富含多糖,而多糖的许多理化性质与RNA很相似,因此很难将它们分开。在去除多糖的同时RNA也被裹携走了,造成RNA产量的减少;而在沉淀RNA时,也产生多糖的凝胶状沉淀,这种含有多糖的RNA沉淀难溶于水,或溶解后产生粘稠状的溶液。由于多糖可以抑制许多酶的活性,因此污染了多糖的RNA样品无法用于进一步的分子生物学研究。在常规的方法中,通过SDS-盐酸胍处理可以部分去除一些多糖;在高浓度Na+或K+离子存在条件下,通过苯酚、氯仿抽提可以除去一些多糖;通过LiCl沉淀RNA也可以将部分多糖留在上清液中。但即使通过这些步骤仍会发现有相当多的多糖与RNA混杂在一起,所以还需要用更有效的方法来解决植物RNA分离纯化时多糖污染的问题。7['X/e,d8x(B-p(|9C&n用低浓度乙醇沉淀多糖是一个去除多糖效果较好的方法。在RNA提取液或溶液中缓慢加入无水乙醇至终浓度10%~30%,可以使多糖沉淀下来,而RNA仍保留于溶液中。一般都是在植物材料的匀浆液中加入乙醇,如Lewinsohn等在从裸子植物的木质茎中提取RNA时,在匀浆上清液中加入乙醇至终浓度10%以沉淀多糖。但Tesniere等在从葡萄浆果组织中提取RNA时,是在用CsCl超离心,乙醇沉淀之后的RNA溶液中加入终浓度30%乙醇来沉淀多糖的,进一步纯化了RNA样品。!i5b5m*z9G8M4~-N/D另一个常用的方法是醋酸钾沉淀多糖法。Bahloul等在提取云杉组织的RNA时在匀浆上清液中加入1/3体积的5M醋酸钾(pH4.8)溶液以沉淀多糖;Ainsworth在提取酸模植物花组织的RNA时加入的是1/5体积的5M醋酸钾(pH4.8)溶液。Hughes等在提取棉花叶和花粉的RNA时是加1/3体积的8.5M醋酸钾(pH6.5)溶液到匀浆液中以除去多糖等杂质。在提取某些植物材料的RNA时,是将上述两种方法结合使用。如Lбpez-Gбmez等在提取芒果中果皮的RNA时,是在匀浆液中加入0.25体积的无水乙醇和0.11体积的5M醋酸钾溶液以去除多糖杂质。Su等在去除褐藻的多糖时,单独使用乙醇或醋酸钾都无效,只有两者结合使用效果最佳。6c9|5q1b9[5l1s+nFang等认为缓冲液中含有高浓度的NaCl有助于去除多糖。Chang等在提取松树RNA时,缓冲液中NaCl的浓度为2.0M和1.0M,通过氯仿抽提和乙醇沉淀RNA将RNA与多糖分离。Manning是将胡萝卜种子等材料苯酚提取后的上清液稀释,调节Na+离子浓度至80mM,然后加入0.4体积的2-丁氧乙醇来沉淀去除多糖。3B1h#M'{+{0U%U,K2@,v蛋白杂质的影响及对策:$@-G5o(f1s9_2V*G2n/^蛋白质是污染RNA样品的又一个重要因素。由于RNase和多酚氧化酶亦属于蛋白质,因而要获得完整的、高质量的RNA就必须有效地去除蛋白杂质。常规的方法是在冷冻的条件下研磨植物材料以抑制RNase等的活性;提取缓冲液中含有蛋白质变性剂,如苯酚、胍、SDS、十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)等,这样在匀浆时可以使蛋白质变性,凝聚;有的方法是利用蛋白酶K来降解蛋白杂质。进一步可以用苯酚、氯仿抽提去除蛋白质。'T7v(F1J9@+EWilcockson利用蛋白质与RNA在高氯酸钠溶液中的溶解度不同将它们分离。在70%高氯酸钠溶液中,RNA的溶解度大于蛋白质的溶解度,因而将大部分蛋白质沉淀下来。接着在离心上清液中加入两倍体积的无水乙醇,这时RNA能沉淀下来而能溶于70%高氯酸钠溶液中的残留蛋白质仍然留在上清液中。这样可以除去绝大部分的蛋白质。3qe/\*I"A&@次级代谢产物的影响及对策::N3|)NfK#np'f6h0J2A0{从植物组织中提取高质量RNA的另一个难点是许多高等植物组织尤其是成熟组织能产生某些水溶性的次级代谢产物,这些次级代谢产物很容易与RNA结合并与RNA共同被抽提出来而阻碍具有生物活性的RNA的分离。因不能确定这些次级产物具体是什么物质,所以,目前还没有什么特殊的方法来解决这个问题。Baker等综合Hughes等的选择性沉淀法、Chirgwin的氯化铯梯度离心法和Iversen等的RNA回收方法纯化了松树种子、成熟松树针叶等植物组织的RNA。(Ms5O%f!H-Q*\(m"`(}由于植物组织特别是高等植物组织细胞内外组成成分的复杂多样性,使得植物组织RNA的提取相对于其它生物材料来说要困难的多。实践中经常会发现,即使同一种植物的不同组织其RNA提取方法会有很大的不同;含有某种干扰因素的不同植物材料,其适用的RNA提取方法可能不同;即使是同一种植物同一种组织材料,但来源于不同基因型植株,其RNA提取方法也可能不一样。所以,对于某一植物或其组织来说,其相应的RNA提取方法必需经过摸索和实践才能确立。#S0a#G7L3S&A随着植物分子生物学研究领域的拓宽,可以肯定地说,在作为其研究基础的植物材料RNA提取过程中还会出现新的难点,但随着不断地探索和经验的积累,科学工作者们一定会迅速地解决这些难点,为植物分子生物学的发展铺平道路。植物RNA提取中的一些特殊方法植物RNA提取中的一些特殊方法$e*[2U(E%h'[多酚类植物的RNA提取:!j!d,]2V(R!B&o苹果棉花等多酚类植物提取RNA用TRIZOL一般提不出来。这个方法是验证过有效的,提取的RNA纯度不是特别高,但是用作northern足够。6j&d2u(\6W8_&o4E1X1t实验试剂:#s7s8H!R#W1y#g提取buffer200ml:NaCl1.1688g100mMTris2.4228g10mM(tris-HCl8.0)EDTA5.8450g10mMSDS2.0000g1%NaOH调至8.0,定至200ml,加200ulDEPC融解.*j)st2@)t4W'F试验步骤:!Ta0I*C(w5S"E*A'W1、1.5ml离心管用液N2冷冻吼加入0.1g样品,立即加入500ul酚氯仿,再加入500ul提取buffer,剧烈振荡1-2min,冰上放置5min。"F3S0V5@0s7i1T2、4度12000rpm离心15min,上清转入新管,加氯仿异戊醇抽提一次。)H'L7d#d"y8@3、取600ul异丙醇,-20度沉淀20min.&w:m2r:I4\4l#J4、12000rpm离心10min。!I.Y.\8b7A5、沉淀用70度乙醇洗。k!T.D1[0w+?)_0D5?6、8000rpm5min。"Ay#}'F(`5}6I+N!x7、沉淀晾干,溶于30ulDEPC水。^0Q-R+`5j(n'['m9M#m/r3o2O!T6z$`1m&e.^银杏等木本裸子植物的RNA提取方法:&Ai&V!H0`?6R银杏、香机等木本裸子植物,酚类和多糖等次生物质含量较多,对RNA的分离和纯化有很大干扰,严重影响了提取RNA的质量和产量,给相关的分子生物学实验的进行带来阻碍。目前,RNA的提取方法很多,采取常规的Trizol试剂盒、SDS等方法不能提取银杏RNA,而ShujunChang等(1993)的CTAB法,提取RNA质量也较差,降解也十分严重。对其提取步骤进行改进,得到质量较高的银杏RNA样品。/s4i*Vk8S)x试验试剂:!]!M(q#E7N3t`#i.m([1、1Mtris:12.11gTris,溶于60mL水中,用浓盐酸调至Ph8.0,定容至lOOmL.用灭菌的DEPC水溶解。`4c9{)p2\4t2、500mMEDTA:18.61gEDTA"H2O加入80mL水中,搅拌溶解,用NaOH调pH至8.0,定容至100mL。V#x*j!H4y!G4M#q3c5P3、10mol/LLiCL:42.4gLiCL,100mL水溶解即可。9i)@a'\&w+cp*g4、提取缓冲液(DEPC水处理):2%CTAB(蛋白质变性剂).2%PVPK30(去除多酚类物质)100mMTris-HCL(Ph8.0)25mMEDTA(金属鳌合剂)2.0MNaCL(去除多糖和CTAB)配法:2gCTAB,2gPVP,10mL1mol/Ltris,5mL500mMEDTA,11.7gNaCL,定容到100mL。)o+\5E!XO#A(M+P8H*K9n0q5、亚精胺(提取时加少量)(RNA酶抑制剂)#J9g6O/h(u'd6、4%0一疏基乙醇(提取时加)(去除多酚类物质)'De,d(J.K$z!O9f7、氯仿异戊醇(24:1)(抽提蛋白质))U)A+]4\#Q8、10MLiCL(沉淀大分子RNA)7M+b)g4J4m5C0f-\9、SSTE(溶解RNA)1.0MNaCL0.5%SDS1mMEDTA(PH8.0)10mMTrisHCL(pH8)配法:2.9gNaCL,0.25gSDS,0.5mL1Mtris,100uL500mMEDTA,pH8.0,定容至50mL。.m5z+J3X0V&\6e7Y#R试验准备:_5z9}"f%q6t1、研钵和玻璃器皿用锡纸包好,200℃以上向温烘烤2小时以上,或180*C高温烘烤4小时。X7n3w,W2}9M2、塑料制品(枪头和离心管)最好用新的,并且用报纸包好,121'C高压灭菌,灭菌40min,或连续两次121'C高压灭菌,每次灭菌20min,然后用烘箱烘千。X*f+~,v7}.a3、所有溶液配制好后,加DEPC水使DEPCuJ浓度为0.1%,37℃过夜,1211C高压灭菌40min.(其中Tris因为不能用DEPC处理,所以Tris用DEPC处理的水溶液灭菌后配制。))x&B,{%e"^&F:s0q试验步骤:"Y6U+`2C*\4X2a#r【根据文献(ShujunChang,1993)CTAB法,稍作改进。】F^+e9I#h/Q7m*A*]1、将4mL提取液加入到lOmL离心管c卜650C水域加热。$D+?4w7\3J:w,M2、用液氮冷却研钵,在研钵中加入少量的抗氧化剂PVP,取1g低温冷冻的银杏叶片,迅速置于研钵中,不时加入液氮以防止研磨过程中叶片融化,充分研磨后,立即加入到预热好的提取缓冲液中,用手摇功混匀。6C4i+L/Z*C5G)v3、65℃,水域1min后冷却至室温。(N2@)U:S,{9M"e8f4、加入等体积(4mL)的氯仿:异戊X17(2=L:1),混匀,10000rpm,40C,离心10min。(H6Po1y8p#?5、小心吸取上清液,加入等体积(4mL)的仿:异戊醇(24:1),混匀,10000rpm,40C,离心10min。.{#k/z5r:x:v1x6、吸取上清液,加1/4体积的IOMLiCL,混合,4℃沉淀过夜,然后10000rpm离心20min。7xP4o6z1D![8}7、用枪吸干,用500uLSSTE溶解沉淀,转到1.5mL离心管.加等体积氯仿:异戊醇混匀,10000rpm,40C,离心10min。,H2b7C1d*[6r4c8、离心吸取取上清液,加两倍体积的无水乙醉,-70℃沉淀至少30min,或一200C下沉淀2h。"W*c'Y1P-t5K)^,`9、12000rpm,40C,离心20min,去上请用70%的乙醇洗两次,吹干沉淀。1x,S*X0V"y6F/l10、用40uLDEPC处理的水溶解沉淀,得到RNA样品。8f2C-S4R3O9R4Te&{11、除用于电泳和紫外检测外,其余RNA-70℃冰箱保存备用。Q0o7V.]9x,{1i:__!U*X1m5G9A(W%U改良Krapp提取法:1r)r#s3~|.q1v.w试验试剂:'C7Z1^)J5A&f&W(Kd1、RNA抽提掖:母液:4mol异硫氰酸胍20mmolEDTA20mmolMESpH7.0。工作液:取400ml母液加入1.7ml2-ME贮存在4℃条件下备用。/a.I$E.RS%z2、RNA重悬液:2molLiCl10mmolNaAc调整终体积为250ml,pH5.2,灭菌后贮存在4℃条件下备用。2uJ1S9V8a.j试验步骤:)O/o,L#q-D8v)U1、取新鲜植物材料0.5~1g,冷冻干燥。如果必要可加入0.2g砂一起研磨,然后加入10mlRNA抽提掖充分混匀。7nQ:B"SN9B!J$u2、4℃条件下8000rpm离心10min,将上层水相转移至一干净离心管中,加入等体积的酚/氯仿抽提掖,在4℃条件下8000rpm离心10min。1N:K+]3R"a7`3、上清液转移至一干净离心管中,再用10ml氯仿洗上清液1次(加入10ml氯仿充分混匀后,在4℃条件下8000rpm离心10min.)。$p+y,P/^-w/E'g"k0y:[4、小心将上清液转移至另一干净离心管中,加入1/10vol3molNaAc和2vol冷无水乙醇,在-80℃条件下沉淀2小时。:t&M8O1O!C-w5a5、在4℃条件下8500rpm离心30min.,小心弃去上清液,沉淀重悬于RNA重悬液中,置于4℃条件下1小时。9b7Z#K4v(y%l8Q0a8N)I%|6、4℃条件下8500rpm离心10min.,弃去上清液,沉淀溶于适当体积的DEOC处理水中。检测后分装,置于-70℃条件下保存。

默默的苗条
追寻的帆布鞋
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牡蛎DNA的提取可以参照Grewe的方法,大致如下:

取牡蛎闭壳肌组织约15mg ,置于700μl 2×CTAB 缓冲液(50mmol/ L Tris-HCl ,pH = 8.0 , 0.7mol/ L NaCl , 10mmol/ L EDTA , 1 % CTAB ,0.1 % 2-巯基乙醇)中 ,以最终浓度为150μg/ ml 的蛋白酶K于65 ℃消化1h ,酚:氯仿抽提,用一倍体积的异丙醇沉淀,70 %酒精清洗2 遍,灭菌双蒸水中溶解, - 20 ℃保存备用。

具体方法可以参考这篇文献:

Mitochondrial DNA variation among Lake Trout (Salvelinus namaycush) strains stocked into Lake Ontario

GREWE P. M. KRUEGER C. C. AQUADRO C. F. BERMINGHAM E. KINCAID H. L. MAY B.

Canadian journal of fisheries and aquatic sciences (Can. j. fish. aquat. sci.)

还有一个类似的方法:

剪取100mg 肌肉组织, 研磨后置于0.7ml 的抽提缓冲液(6mol/ L urea , 10mmol/ L Tris-HCl , 125mmol/ L NaCl , 1 % SDS , 10mmol/ L EDTA ,pH = 7.5) 中,加入35μl 的蛋白酶K(20mg/ ml ) ,37 ℃消化一夜。用苯酚∶氯仿(1∶1) 抽提反应物,异丙醇进行沉淀,然后溶解于TE (10mmol/ L Tris-HCl , 1mmol/ L EDTA , pH = 8.0 ) 中。用RNase(20μg/ ml) 37 ℃处理DNA 样品1h ,然后用苯酚/ 氯仿提取液进行DNA 纯化。