为什么要使用tris饱和苯酚而不直接用苯酚
市售酚中含有醌等氧化物，这些产物可引起磷酸二酯键的断裂及导致RNA和DNA的交联，应在160℃用冷凝管进行重蒸。重蒸酚加入0.1%的8-羟基喹啉(作为抗氧化剂)，并用等体积的0.5mol/L Tris·Cl (pH8.0)和0.1mol/L Tris·Cl(pH8.0)缓冲液反复抽提使之饱和并使其pH值达到7.6以上，为Tris饱和酚（pH7.8左右）。
饱和酚在核酸纯化中有2种，一种为Tris饱和酚（pH7.8左右），故也称为碱性酚。另一种就是酸性酚，也就是水饱和酚。用于RNA提取时，则要制备酸性酚，也就是水饱和酚，因为在酸性条件下，RNA被分配于水相，而DNA在有机相，从而达到分离获得RNA的目的。水饱和酚同时能使蛋白质变性、沉淀，从核酸提取液中将蛋白质分离除去。因此，pH值不同，应用不同，切不可弄混，以免造成实验失败。
配制方法： 在大烧杯中加入80mL去离子水，再加入300g 苯酚，在水浴中加热搅拌、混合至苯酚完全溶解。将该溶液倒入盛有200mL去离子水的1000mL分液漏斗中，轻轻振荡混合，使其成为乳状液。静止7～10小时，乳状液变成两层透明溶液，下层为被水饱和的酚溶液，放出下层，贮存于棕色瓶中备用。 有商品化试剂更方便。
通常，氯仿与异戊基发酵的比例为24：1。 苯酚，氯仿和异戊醇的比例也可以按25：24：1的比例使用。
提取DNA时，为了均匀混合，必须将容器摇动几次，并且在混合溶液中容易产生气泡，并且气泡会阻止相互作用。 异戊醇的添加降低了分子的表面张力，因此减少了萃取过程中泡沫的产生。
扩展资料
酚:氯仿:异戊醇试剂是由水饱和酚、氯仿和异戊醇按125:24:1 的体积比混合而成的，主要用于RNA的提取等试验。苯酚使蛋白质变性，同时抑制了 RNase 的降解作用。
氯仿抽提加速有机相与液相分层，去除核酸溶液中的迹量酚。异戊醇减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。使用酚：氯仿：异戊醇抽提离心后的上层为含 RNA 的水相、中间为变性蛋白与 DNA，下层为有机溶剂相。静置后产品有分层现象，使用时将产品摇匀后用移液器吸取即可。
注意事项：酚:氯仿:异戊醇试剂有较强的腐蚀性，应尽量避免皮肤接触或吸入体内。如发现变为红色或棕色，表明已发生氧化，不能继续使用。
参考资料来源：百度百科-苯酚
参考资料来源：百度百科-氯仿
参考资料来源：百度百科-异戊醇
水的酚溶液，是每个水分子都处在酚分子周围，酚的周围大多数还是酚；而酚的水溶液，是每个酚分子都处在水分子周围，水分子的周围大多数也还是水。
因为分子所处的环境不同，所以它们各自的溶解度一定不同，也就是说，饱和的水的酚溶液与饱和酚的水溶液，各自的水和酚所占的百分比是不同的。
一、水饱和酚又叫水平衡酚。水饱和酚的PH小于7，一般是PH为5.0左右，通常与异硫氢酸胍一起使用，用于细胞RNA的提取，在酸性环境中，DNA在酚相，RNA在水相。两者就分开了。
二、Tris饱和酚一般PH大于7.8，用于DNA的提取。其中，酚是强的蛋白变性剂，可以使细胞或组织中的蛋白质变性析出。 而Tris的主要作用是防治止酚类氧化，若酚类氧化，则会形成醌（两个苯环），醌含有强自由基，会破坏核酸结构。 同时，由于PH值大于7，在碱性环境中DNA处于水相，RNA处于有机相。从而分离上清，即可得到DNA。
Tris饱和酚的配置：
1、冰箱取出重蒸酚，室温放置－－－68度水浴溶化，切勿立即放入68度的水浴中，以防玻璃炸裂
2、加8－羟基喹啉至0.1％和β－巯基乙醇至0.2％，（原液14. 4MOL/ML），混匀，溶液呈现黄色，倒入分液漏斗中（也可在烧杯中进行）
3、加入等溶剂的1MOL/ML的Tris(PH8.0),反复混匀后，静至分层；放出下层黄色酚液，弃上层
4、加固体Tris约1g/100ml酚，摇匀，去水相
5、加0.1MOL/MLTris(PH8.0)平衡数次，至PH为8.0
6、加0.1MOL/MLTris(PH8.0)于棕色瓶中4度保存
7、如黄色消失或呈粉红色（说明酚已经被氧化），则不能使用
我记得我配的时候，就是酚取下层，把三种溶液混合，摇一摇，放4度几个小时后用
但是我记得我用的是Tris饱和酚，
Tris平衡苯酚也称Tris平衡酚或Tris饱和酚(Tris balanced phenol或Tris saturated phenol)，是添加了抗氧化剂8-羟基喹啉， Tris，pH8.0充分平衡的苯酚。呈黄色
不知道你的那个水饱和的苯是否可以~~~~
