计算机辅助药物设计(cadd)的就业前景怎么样？
比较不错，未来几年乘着国家医改的东风，医药行业将会有大发展。所以需要人才，就业当然好。
药物设计是伴随着药物化学学科开展的，在20世纪70年代之后，药物设计开始综合运用药物化学、分子生物学、量子化学、统计学基础理论和当代科学技术以及电子计算机等手段，开辟了药物设计新局面。
在未来，随着结构生物学、X晶体学的发展，酶的性质、反应历程、药物与酶等受体的复合物的精细结构得到阐明，模拟与受体相结合的药物活性构象的计算机分子图像技术在新药研发中已取得可喜的成果。
药物靶点的发现与确证：对基因组学、蛋白质组学等数据进行采集、存储、分析和处理开发的软件，如NCBI的BLAST(多重序列对比软件)进行多种序列对别。
先导化合物的发现与优化：基于受体结构的药物设计，是根据药物靶点结构，研究蛋白和小分子之间的相互作用，设计与活性口袋互补的新分了和寻找新型先导化合物的技术，含分子对接和从头设计，如卡托普利(抗高血压)、扎那米韦(抗流感药物)。
计算机辅助药物设计的一般原理是，首先通过X－单晶衍射技等技术获得受体大分子结合部位的结构，并且采用分子模拟软件分析结合部位的结构性质，如静电场、疏水场、氢键作用位点分布等信息。然后再运用数据库搜寻或者全新药物分子设计技术，识别得到分子形状和理化性质与受体作用位点相匹配的分子，合成并测试这些 分子的生物活性，经过几轮循环，即可以发现新的先导化合物。因此，计算机辅助药物设计大致包括活性位点分析法、数据库搜寻、全新药物设计。
包括3D-QSAR方法、药效团模型法和在此基础上的三维结构搜寻方法等
1． 活性位点分析法
该方法可以用来探测与生物大分子的活性位点较好地相互作用的原子或者基团。用于分析的探针可以是一些简单的分子或者碎片，例如水或者苯环，通过分析探针与活性位点的相互作用情况，最终可以找到这些分子或碎片在活性部位中的可能结合位置。由活性位点分析得到的有关受体结合的信息对于全新药物的设计具有指导性。 活性位点分析软件有DRID、GREEN、HSITE等。另外还有一些基于蒙特卡罗、模拟退火技术的软件如MCSS、HINT、BUCKETS等。
其中，GRID由Goodford研究小组开发，其基本原理是将受体蛋白的活性部位划分为有规则的网格点，将探针分子（水分子或甲基等）放置在这些网格点上，采用分子力场方法计算探针分子与受体活性部位各原子的相互作用能，这样便获得探针分子与受体活性部位相互作用的分布情况，从中可发现最佳作用位点。 GRID最初运算的例子是用水分子作为探针分子，搜寻到了二氢叶酸还原酶（DHFR）活性部位中水的结合位点以及抑制剂的氢键作用位点。由此软件成功设计 的药物有抗A型感冒病毒药物4－胍基Neu5Ac2en（GG167， RelenzaTM）。该化合物有很强的抗感冒病毒能力，克服了以往抗感冒病毒药物的耐药性缺陷，具有很好的市场前景。
MCSS是 Miranker和Karplus在CHARMM力场基础上发展而来，它的基本要点是在运用 CHARMM力场进行分子动力学模拟时，取消溶剂分子间的非键相互作用。这样，在分子动力学模拟时，溶剂在能量合适的区域叠合在一起，从而提高了搜寻溶剂 分子与受体分子结合区域的效率。小分子碎片（如水和苯分子）可当作溶剂分子，运用上述动力学方法搜寻出分子碎片与受体的结合区域，然后对每个碎片选择 100－1000个拷贝，在低能碎片结合域进行能量优化。在最后的能量搜寻过程中，可以用随机取样或网格点的方法来实施。搜寻时每个碎片的各个拷贝可以作 刚性转动，最后直接比较每个碎片各个拷贝与受体的结合能，以此选择碎片的最佳作用位点。2001年Adlington等利用MCSS对前列腺特异性免疫抗 原（PSA）的活性位点进行了详细分析，以此对已有的PSA抑制剂进行结构优化，从而得到了迄今为止活性最高的PSA抑制剂。
