二线品牌门窗排名
二线品牌门窗排名为：罗普斯金门窗、栋梁铝材门窗、金鹏铝材、松竹铝材、奋安、豪美铝业、高登铝材、闽发铝业、云铝铝材等等。
门窗二线品牌排行有罗普斯金门窗、栋梁铝材门窗、金鹏铝材、松竹铝材、奋安、豪美铝业、高登铝材、闽发铝业、云铝铝材、广铝、闽鑫、凤美、栋明、和平、江西金鑫发、四川三星堆、西安高科、安徽生信、河北力尔、辽宁托田、国一、丛林河等等品牌。
门窗选择有什么技巧
1、选择门窗技巧类别的选择
目前门窗市场上常见门窗种类大致可分为：铝合金门窗、塑钢门窗、不锈钢门窗等几大类。铝合金材料强度高的特点，相比其他材质门窗优势较为明显。近年来，铝合金门窗以强度高、密闭性能好、美观、耐用等优点越来越受广大用户喜爱。
2、选择门窗技巧材料的选择
铝合金门窗的质量可以从原材料（铝型材）的选材、铝材表面处理及内部加工质量、铝合金门窗的价钱等方面来作大致判断。
3、选择门窗技巧性能的选择
除玻璃的选择外，胶条的品质，五金配件等的质量也往往是影响窗体使用性能的重要因素。好的胶条具有高密封性、耐热性、高弹性，使窗的隔音隔热效果，好的五金配件可以使门窗超长耐久。
4、选择门窗技巧美观的选择
好的窗体，加工精细、切线流畅、角度一致、手感温润、纹理细腻。选购窗户时用户除窗体本身质感外，还要注意，风格与颜色都要达到协调统一。
简介：安徽生信铝业股份有限公司创建于2003年，位于宣城经济技术开发区创业路,属安徽省民营百强企业，为安徽省最大铝型材生产企业。总资产3.1亿元，占地面积24万平方米。公司拥有国际先进水平的现代化的熔铸、挤压、氧化着色、粉沫喷涂（其中先进的立式喷涂生产线为省内独有）、电泳涂装、氟碳喷涂、木纹转印及环保节能断热冷桥等生产线四十余条，具备年产六万吨铝型材的生产能力。2012年完成产值超5亿元，利税2500万元。
公司采用先进自动化生产工艺，运用ISO9001质量管理体系和ISO14001环境管理体系，以及先进完善的测量监控装置，专业生产具有国际先进水平的中、高档建筑门窗型材、幕墙型材、装饰型材和工业型材，还可按客户需要设计生产各种技术要求高的特殊工业型材。产品广泛适用于住宅小区、别墅山庄、高层建筑、车站广场、机场建设等。产品已销往安徽、浙江、江苏、上海、山东、河南、内蒙古等十八个省市自治区，并销往亚洲、非洲、欧洲、美洲等国外市场。
生信牌铝型材深受广大用户好评，先后获得国家免检产品、安徽名牌产品、苏浙皖赣沪名牌产品50强等多项荣誉称号；生信商标先后被认定为安徽着名商标、中国驰名商标；企业先后荣获安徽省社会保障和就业先进企业、安徽省重合同守信用企业、安徽省质量管理奖、AAA标准化良好行为企业、 安徽省认定企业技术中心、安徽省首届品牌百强企业、安徽省高新技术企业等荣誉称号。公司为安徽省铝合金型材产品标准化技术委员会秘书处承担单位，公司董事长徐武清同志任该委员会主任。
目前公司已获得21个项国家专利，八项软件着作权；企业作为全国非建筑用铝合金装饰型材生产技术权威企业代表，参与了《非建筑用铝合金装饰型材》（GB/T 26014-2010）和《光伏系统用铝合金型材》（YS/T773-2011）国家标准的起草工作，两个标准现均已发布。
公司本着您的满意是我们永恒的追求的经营理念，坚持科学管理、质量第一、诚信经营、持续改进的质量方针，坚持品牌发展战略，走科技创新之路，以更完美更环保的产品，更优质高效的服务回报于社会，生信将在不断的自主创新中发展壮大、走向辉煌。
法定代表人：徐武清
成立日期：2003-07-08
注册资本：10363.71万元人民币
所属地区：安徽省
统一社会信用代码：913418007509901461
经营状态：存续（在营、开业、在册）
所属行业：制造业
公司类型：股份有限公司(非上市、自然人投资或控股)
英文名：Anhui Shengxin Aluminium Group Co., Ltd.
人员规模：1000-4999人
企业地址：安徽省宣城市经济技术开发区创业路
经营范围：型材生产、销售废旧物资回收(国家禁止的除外)门窗及配件的销售。
013 建筑型材 江阴鑫裕装潢材料有限公司 鑫裕 阳极氧化、电泳涂漆、粉末喷涂、隔热型材（XY系列）
014 建筑型材 江阴裕华铝业有限公司 佳裕 铝合金建筑型材（门窗、幕墙型材）
015 建筑型材 苏州罗普斯金铝业有限公司 罗普斯金?
LPSK、罗普斯金?、LPSK?、第一勇? 铝合金阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、 粉末喷涂型材、氟碳漆喷涂型材、隔热型材
016 建筑型材 吴江市东方铝业有限公司 四强 阳极氧化着色、电泳涂漆、粉末喷涂型材
017 建筑型材 吴江市永亨铝业有限公司 亨利 阳极氧化着色、电泳涂漆、粉末喷涂型材
018 建筑型材 张家港鑫宏铝业开发有限公司 鑫冠 铝合金建筑型材（门窗、幕墙型材）
019 建筑型材 宁波锦华铝业有限公司 华神 阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材粉末喷涂型材 、隔热型材
020 建筑型材 浙江栋梁新材股份有限公司 栋梁 铝合金建筑型材（门窗、幕墙型材）
021 建筑型材 浙江乐祥铝业有限公司 乐祥 阳极氧化、电泳涂装、粉末喷涂
022 建筑型材 宣城市东维铝业有限责任公司 东维 阳极氧化着色型材、粉末喷涂型材
023 建筑型材 宣城市生信型材有限责任公司 生 信 铝合金建筑型材系列
024 建筑型材 福建闽发铝业有限公司 闽发 基材、阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材、氟碳漆喷涂型材、隔热型材
025 建筑型材 福建南平铝业有限公司 闽铝 基材、阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材、氟碳漆喷涂型材、隔热型材
026 建筑型材 福建省华银铝业有限公司 闽鑫 基材、阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材、氟碳漆喷涂型材、隔热型材
027 建筑型材 福建省龙岩市连发铝业有限公司 连发 阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材
028 建筑型材 福建省三源金属制品有限公司 三源 基材、阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材、氟碳漆喷涂型材、隔热型材
029 建筑型材 福建省永春双恒铝材有限公司 双恒 6063.T5
030 建筑型材 茌平县方正铝业有限公司 红豹 铝合金建筑型材系列
031 建筑型材 山东丛林集团有限公司(子公司、分公司见证书） 丛林河 铝合金建筑型材系列
032 建筑型材 山东华建铝业有限公司 华铝 铝合金建筑型材
033 建筑型材 山东金锣新福昌铝业有限公司 新福昌 门窗、幕墙用铝合金建筑型材
034 建筑型材 山东金象铝业有限公司 白象 铝合金建筑型材（门窗料、幕墙料）
035 建筑型材 山东铝业股份有限公司(子公司、分公司见证书） 山铝 铝合金建筑型材
036 建筑型材 山东蒙山铝业有限公司 蒙山 门窗料系列铝合金建筑型材
037 建筑型材 山东南山实业股份有限公司(子公司、分公司见证书） 南山牌 铝合金建筑型材系列
038 建筑型材 山东伟业铝材有限公司 山一+图形 铝合金建筑型材（门窗、幕墙型材）
039 建筑型材 山东新大地铝业有限公司 新大地 铝合金建筑型材系列
040 建筑型材 山东鑫鑫铝业有限公司 鑫鑫＋图形 门窗用、幕墙用铝合金型材
041 建筑型材 淄博松竹铝材有限公司 松竹 铝合金建筑型材（B55、70、75、80、85、90、120、140、150）
042 建筑型材 大冶市宏泰铝业有限责任公司 虹泰 铝合金建筑型材系列
043 建筑型材 湖北幸福铝材有限公司 宫殿 铝合金建筑型材6063-T5
044 建筑型材 黄石市晨茂铝业有限公司 晨茂 铝合金建筑型材76.90.828.2000.2008
045 建筑型材 黄石市福星铝业有限公司 福满门 铝合金建筑型材系列
046 建筑型材 武汉源泰铝业有限公司(子公司、分公司见证书） YUANTAI 各种门窗、幕墙铝型材
047 建筑型材 长沙新振升集团有限公司 振升 阳极氧化、着色型材电泳涂漆型材
048 建筑型材 湖南经阁投资控股集团有限公司 经阁 阳极氧化着色、电泳涂漆、粉末喷涂、氟碳漆喷涂、隔热型材
049 建筑型材 佛山金兰铝厂有限公司 金兰 铝合金建筑型材系列
050 建筑型材 佛山市季华铝业公司 季华 门、窗、幕墙系列铝合金建筑型材
051 建筑型材 佛山市罗南铝业有限公司 罗翔 阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材
052 建筑型材 佛山市南海广源铝业有限公司 CR（图案） 阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材
053 建筑型材 佛山市南海宏佳铝业有限公司 宏佳 铝合金建筑型材系列
054 建筑型材 佛山市南海华豪铝型材有限公司 华豪（图案）、豪顺（图案） 阳极氧化着色、电泳涂漆、粉末喷涂、隔热型材系列
055 建筑型材 佛山市南海区大沥中亚铝型材有限公司 亚亚 阳极氧化型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材、隔热型材
056 建筑型材 佛山市南海区佳华铝型材有限公司 佳华 电泳、喷涂、氧化着色型材系列
057 建筑型材 佛山市南海区建宝铜铝业有限公司 裕兴、金美 铝合金建筑型材系列
058 建筑型材 佛山市南海区中联铝型材有限公司 ZHL 铝合金建筑型材系列
059 建筑型材 佛山市南海艺华不锈钢铝业有限公司 艺华（图案） 铝合金建筑型材系列
060 建筑型材 佛山市南华铝业有限公司 南华（图案） 铝合金建筑型材（门窗幕墙）
061 建筑型材 佛山市新合铝业有限公司 （图案） 铝合金建筑型材（铝合金门窗、幕墙）
062 建筑型材 佛山市兴亚铝业有限公司 南大 阳极氧化型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材
063 建筑型材 广东大明铝合金型材有限公司 大明 阳极氧化着色型材、粉末喷涂型材、电泳涂漆型材、隔热型材
064 建筑型材 广东凤铝铝业有限公司(子公司、分公司见证书） 凤铝（图案） 铝合金建筑型材（6063－T5）
065 建筑型材 广东广铝铝业有限公司(子公司、分公司见证书） 广铝 铝合金建筑型材6063T5
066 建筑型材 广东豪美铝业有限公司 豪美 6063铝合金建筑型材
067 建筑型材 广东华昌铝厂有限公司(子公司、分公司见证书） WACANG、伟昌 门、窗、幕墙系列铝合金建筑型材
068 建筑型材 广东会丰铝业有限公司 会丰 阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材
069 建筑型材 广东坚美铝型材厂有限公司 坚美 阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材、氟碳漆喷涂型材、环保隔热型材
070 建筑型材 广东金协成铝业有限公司 协力 铝合金建筑型材6063－T5
071 建筑型材 广东伟业铝厂有限公司 WEIYE、伟业、广惠 阳极氧化着色、电泳涂漆、粉末喷涂型材
072 建筑型材 广东兴发铝业有限公司 兴发 阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材、隔热型材、氟碳漆喷涂型材
073 建筑型材 广东亚洲铝厂有限公司(子公司、分公司见证书） 南亚 阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材、氟碳漆喷涂型材、隔热型材
074 建筑型材 广东银一百铝业有限公司 银一百 阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材、隔热型材
075 建筑型材 广东永兴铝型材厂有限公司 星球（图案） 阳极氧化着色型材、电泳涂漆型材、粉末喷涂型材
076 建筑型材 广亚铝业有限公司 广亚 铝合金建筑型材6063T5
077 建筑型材 广州铝业有限公司 广灏 铝合金建筑天花、墙板系列
078 建筑型材 清远市美亚宝铝业有限公司 美亚宝铝业 阳极氧化、电泳涂漆、粉末喷涂、氟碳漆喷涂
079 建筑型材 清远市清城区华南铜铝业型材厂 银韧华南 阳极氧化、电泳涂漆、粉末喷涂
080 建筑型材 平果亚洲铝业有限公司 金平果 阳极氧化、着色，电泳涂漆，粉末喷涂，氟碳喷涂，隔热型材系列
081 建筑型材 重庆新美鱼博洋铝业有限公司 美鱼、博洋 铝合金建筑型材
082 建筑型材 成都阳光铝制品有限公司 彩 铝合金建筑型材（门料、窗料、幕墙、隔热型材）
083 建筑型材 四川广汉三星铝业有限公司 三星堆 铝合金建筑型材（门窗系列、幕墙系列）
084 建筑型材 西安飞机工业铝业股份有限公司 西飞 铝合金
建筑型材（铝门窗、幕墙型材）
085 建筑型材 西安西航集团铝业有限公司 西航 铝合金牌号6063、6061
086 建筑型材 甘肃宏达铝型材有限公司 精益 铝合金建筑材料（门窗料、幕墙料）
087 建筑型材 兰州铝型材厂 铭帝 铝合金建筑材料（门窗型材、幕墙型材、工业型材）
088 建筑型材 青海金溢新型铝型材有限公司 金溢、西北金 铝型材（建筑和民用系列型材）
089 建筑型材 青海铝型材厂(子公司、分公司见证书） 胜强牌 铝型材（建筑和民用系列型材）
一、什么是BSA?
BSA（Bulked Segregant Analysis）---混合分组分析法
>根据目标性状表现型，对表型分离群体中的个体/株系依据目标性状，分成性状差异显著的两组
>然后将 两组 的个体或株系DNA分别 等量混合 ，形成性状相对的 DNA混合池 。
>再然后 建库 、 测序 、 分析 的方法（根据亲本间纯和差异的位点，计算子代池的index值，进而挑选差异较大的位点
>可以实现目标性状的基因定位
二、BSA适应的群体类型
三、BSA分析的目的
通过对极端性状产生机理的研究与发展，完成家系材料单性状基因的定位，揭示性状相关机制，应用实际生产过程中， 达到育种期望，提高生产效益。
选择样本：极端亲本1和2；极端子代混池1和2
主要分析的内容：根据SNP/INDEL频率差异分析，确定与极端性状紧密相关的分子标记，并完成定位基因；目的基因功能注释。
四、生物信息分析流程
1、GATK 群call--vcf
2、变异位点注释
3、index计算
3.1 挑选亲本间纯合差异的位点
3.2 SNP-index的计算（极端亲本P1为参考，分别计算两个子代在亲本间上述标记位置上的SNP-index）
候选位点：挑选极端性状子代混池1（跟参考亲本性状相同）的SNP-index接近0，且子代2（与参考亲本性状相反）的SNPindex接近1的位点
3.3 选择1Mb为窗口，1kb为步长，计算每个窗口中SNP-index
4、目标性状的定位
对于候选的多态性标记位点进行ANNOVAR的注释，提取注释结果，优先挑选upstream或者引起stop loss或者stop gain或者非同义突变或可变剪接的位点所在的基因作为候选基因；
4.1. 外显子上的候选位点：
4.2.nonsynonymous的位点所在基因以及upstream相关基因：
5、目标基因的定位
五、流程回顾
六、常见问题
1、简化基因组BSA比全基因组BSA价格便宜?
答:简化基因组技术,捕获的基因组信息占基因组大小约1%~10%,全基因组技术,对至少25倍
2、简化基因组测序适合做BSA性状定位吗?
答:针对微效多基因控制的数量性状,与目标性状相关的位点很多,简化基因组或许有幸捕获到少数位点,但绝大部分会被遗漏,这对后续的研究很不利。针对质量性状或由少数主效基因控制的数量性状,简化基因组BSA的方法风险更高。全基因组BSA性状定位与简化基因组BSA性状定位见表2-1
3、子代混池的样品个数和测序深度如何设计?为什么?
答: 2013年, James等对混池个体数和测序深度对候选基因数的影响进行了评估。下图是评估结果,结果显示,当子代个数超过20个,测序深度达到25x以后,候选基因个数会趋于平衡,不会有更明显的提升效果。基于以上文章经验以及已完成的BSA项目经验,推荐20个个体进行混池,每池20×的测序深度。
4、DNA样品如何混池?先混样再提DNA?还是先提DNA再等量混合?
答:先提DNA再等量混合,可以减少系统误差,近年发表的多数文献都是先提DNA再等量混合。
5,能否只测亲本?或者只测子代池?或者只测1个子代池?
答:分两种情况:
1)如果研究的性状是EMS诱导的突变性状,可以只测两个子代池(野生型+突变型)或者测1个亲本(野生型)和1个子代池(突变型)。
2)如果研究的性状是数量性状,最好测2个亲本和2个子代池,用一个实际在线项目评估了样品个数对分析结果的影响,其中4个样品的结果最好(也即2个亲本+2个子代池),其次是测一个亲本和两个子代池,如果只测两个子代池,假阳性会很高,找出来的SNP很多(下表)。
6,能否保证定位到的候选区域的大小和候选基因的个数?
答:候选区域的大小和候选基因个数的多少,与群体的大小、亲本材料差异的大小、目标性状特点、测序深度的多少、分析物种的基因组水平等多项因素相关,因此不能给出统一的标准,但可以参考已完成的项目经验进行估计。
7,没有参考基因组的物种能否做BSA性状定位?
答:没有参考基因组的物种可以进行SNP频率差异分析,可以找到侯选这段,但是无参定位效果较差,并且缺少注释文件,获得的结果少无参物秤一般情况不推荐做BSA性状定位,建议尝试遗传图谱等方案。
8,多倍体物种可以进行BSA性状定位吗?
答:有参考基因组的多倍体物种,例如: “油菜",可以用BSA进行性状定位。
9, BSA性状定位可以利用InDel进行定位分析吗?
答:使用SNP标记进行定位的主要原因是SNP在基因组上的分布密度要比InDelSSR,SV,CNV等要高,使用SNP标记可以找到比较精确的区间。找到候选区间之后,可以对候选区间中的InDel和其他变异进行检测。直接利用InDel信息进行定位缺少文献支持,并且定位效果不如SNP效果好。
10,人工诱变只能是EMS诱变嘛?其他诱变方式得到的性状可否采用BSA性状定位?
答: BSA性状定位是基于SNP,通过比较SNP频率差异进行分析的, EMS诱发的是点突变,所以EMS诱发的突变适合这种分析方式其他的诱变方式诱发的大部分是结构变异,在SNP水平上可能找不到导致目标性状差异的区域，所以不适合SNP频率分析的方法。
11,全基因组(WGS ) BSA性状定位与转录组(RNAseq )进行性状定位的比较。
答: 2013年,Henke等总结了全基因组BSA相比转录组( RNAseg进行性状定位的优点
1)覆盖范围:全基因组BSA可以覆盖整个基因组, 98%的编码区可以覆盖到。而RNAseq只对编码区进行测序。
2)基因检测的偏好性:全基因组BSA对基因的检测较均匀,无偏好性,不受时间或者组织的影响。RNAseq偏向于在特定时间或者组织中高表达的基因。
3)区域偏好性:基因分布不均匀,若一些区域基因密度低,用RNAseq可能漏掉。
4)多态性:基因组的多态性多数位于非编码区,采用RNAseq检测到的多态牲较低,只有少数与突变位点连锁的多态性标记能被RNAseq检测到。
因此,采用全基因组BSA更容易检测到与目标基因连锁的多态性标记。
后续更新。。。。。
QTL-seq（数量性状）
MutMap（点突变性状）
InDel-seq（InDel突变性状）
转录组BSA
拉马提出进废退理论。他说生物经常使用的器官会逐渐发达，不经常使用的器官会逐渐退化。而且这种后天获得的性状是可以遗传的，因此生物可以把后天锻炼的成果遗传给下一代。拉马克举了长颈鹿的例子。
反对
拉马克主义提出后，生物界支持声和反对声此起彼伏。先来听听反对他的声音。德国科学家魏斯曼做了一个实验。他把老鼠的尾巴都切断，之后再让没有尾巴的老鼠互相交配，生出的下一代老鼠依然是有尾巴的。然后再把子代老鼠的尾巴切断之后交配，生出的下一代老鼠依然是有尾巴的。实验一直重复至第 21 代，但是老鼠的尾巴依然长长的，一点儿都没短。于是魏斯曼说拉马克是错的！
支持
再来听听支持的声音。水生的雄蟾蜍都有一个黑色的趾垫，而陆生的没有。奥地利科学家卡姆梅勒，强迫陆生的产婆蟾在水中生活。繁殖了几代之后就绝种了。但是在绝种之前，产婆蟾的雄蟾蜍据称是长出了黑色的指垫，而且水中生活的这几代，趾垫越来越明显。
达尔文认为“物竞天择”意味着，存在一种最初的生物，之后通过某种方式得到了改良。如果环境对你施加压力，压力有可能是捕食者的威胁或类似的情况，那些通过某种手段生存下来，并且繁衍后代的生物，他们的后代也能生存下来，并且继续繁衍生息。因此，如今我们所见到的动植物都拥有很强的适应性。
分子水平是指 DNA、RNA、以及蛋白质序列。
同源（Homologs），相同来源。
它的确切定义是，来源于共同祖先的相似序列为同源序列。
也就是说，相似序列有两种，一种是来源于共同祖先的，那么他们可以叫同源，另一种不是来源于共同祖先的，那么他们尽管相似也不能叫同源。
第二种情况出现的概率虽然低，但还是存在的，所以相似序列并不一定是同源序列。
同源又分为三种，直系同源，旁系同源和异同源。
直系同源（Orthologs）
是指，来自于 不同物种的由垂直家系 ，也就是物种形成，进化而来的基因，并且典型的保留与原始基因相同的功能。也就是说，随着进化分支，一个基因进入了不同的物种，并保留了原有功能。这时，不同物种中的这个基因就属于直系同源。
旁系同源（Paralogs）
是指在 同一物种中的来源 于基因复制的基因，可能会进化出新的但与原功能相关的功能来。
基因复制产生了两个重复的基因，多出来的这个有几种命运，一个是又丢了。复制出来发现没有用，又删了。另一种命运是演化出了新的功能。
如果这个新功能是往好的方向发展，就会被保留下了，如果是往不好的方面发展，就会被自然选择淘汰。
还有一种命运，就是被放置不用。复制出来以后，又加了个终止子，既不表达，也不删除，搁那里搁着不管，成了伪基因。
被保留下来的具有新功能的基因与另一个复制出来的基因之间就是旁系同源。
异同源（Xenologs）
是指通过水平基因转移，来源于共生或病毒侵染所产生的相似基因。
异同源的产生不是垂直进化而来的，也不是平行复制产生的，而是由于原核生物与真核生物的接触，比如病毒感染，在 跨度巨大的物种间跳跃转移产生 的。
在计算机科学领域，树的定义规定，树上从一个点到另一个点的路径只有唯一的一条。而当两点之间的路径个数≥2 的时候，就形成了网。
编织生命网的要素之一就是水平基因转移。水平基因转移，是指生物将遗传物质传递给其他细胞而非其
子代细胞的过程。
研究分子进化所要构建的系统发生树（Phylogenetic tree），也叫分子树。
树是从根（root）长出来的。从根延伸出的树枝就叫枝（branch/lineage）。枝上有分叉，分叉的地方就叫节（node）。枝的顶端顶着的就是叶（leaf）。根、节和叶都可以叫做节点（node）。但是叶后面不再有枝了，是最外面的节点，所以叫外节点（outer node）。而节的前后都有枝，所以叫内节点（inner node）。根是一切的起源，习惯上就叫根。 根和节都表示理论上曾经存在的祖先，叶子是现存的物种。
形状表示生物学意义都一样。如序列多，用原型，方便paper排版。
根，它应该是所有叶子的共同祖先。
外类群（outgroup）来确定，从而把无根树变成有根树。
有根树反映了树上基因或蛋白质进化的时间顺序,通过分析有根树的树枝的长度，可以了解不同的基因或蛋白质以什么方式和速率进化。
而无根树只反映分类单元之间的距离,而不涉及谁是谁的祖先问题。
做有根树需要指定外类群。所谓外类群，就是你所研究的内容之外的一个群。
1998 年，伍斯提出了一个涵盖整个生命界的系统树。
物种树是基于每个物种整体的进化关系，也就是基于整个基因组构建的，而分子树是基于不同物种里某一个基因或蛋白质序列之间的关系构建的。
4.4系统发生树的构建
从实用的角度，建议使用 最大似然法 。因为这种方法无论从速度还是准确度都比较适中。
最近邻居法虽然算得快，但是当序列多，彼此差别小的时候，这种方法不适合。
最大简约法，似乎是个掉空里的方法，高不成低不就，所以很少有人使用。
贝叶斯法不是所有的建树软件都提供，算法开发上还有待提高，而且计算时间过长。
目前流行的建树软件,PHILIP 和 MEGA，基本能够包括上述所有算法。
以非加权分组平均法（UPGMA 法）为例，介绍如何通过计算所有序列两两间的距离，再根据距离远近构建系统发生树。序列两两间的距离可以用双序列比对得出的一致度/相似度代表，或用其他简化值代替。
经单碱基计算后，AB序列距离最小。按0.5,0.5长度构建AB的的系统发生树。
将AB看成整体，分别计算C、D的距离。在新表中，最小距离为C、D。按1,1距离进行构建C、D的系统发生树
将CD与AB进行比较，为3，构建1.5，1.5距离的系统发生树。完成四条序列的建树。
序列的选取要遵循以下原则：
1）如果 DNA 序列两两间的一致度≥70%，选用 DNA 序列。
因为，如果 DNA 序列都如此相似，它们对应的蛋白质序列会相似到几乎看不出区别。这对于构建系统发生树是不利的。所以这种情况选用 DNA 序列，而不选蛋白质序列。
2）如果 DNA 序列两两间的一致度<70%，DNA 序列和蛋白质序列都可以选用
1）软件免费；
2）软件在默认设置下建树的效果就很好；
3）软件被业界普遍认可，做出结果可以用于文章发表；
4）软件支持多操作系统，而且安装简单。
MEGA7 是完全的图形化界面操作（ http://www.megasoftware.net/ ）。
示例
在接下来的例子里我们要为附件中 TIR.fasta 里的序列构建 NJ 树。
TIR.fasta 里存储了 10 条人的不同 Toll 样受体胞内域的氨基酸序列。只有具有一定亲缘关系，也就是彼此比较相似，但又存在一定差别的序列拿来做多序列比对，或拿来构建系统发生树才有意义。
File输入数据
Align方式打开文件
成功导入后，排列不整齐
选择“Align”之后，在弹出的 Alignment Explorer窗口上点击 Alignment Align by ClustalW。
MEGA 提供 ClustalW 和 Muscle 两种多序列比对方法。
这里选择熟悉的 ClustalW 方法。弹出窗口询问“Nothing selected for alignment.Select all? （是否要选择所有序列来做多序列比对) ”，选择 OK。
MEGA 的所有默认参数都不是随便设置的，这些经过反复考量默认设置好的参数保证了 MEGA 傻瓜机全自动档的品质。
所以，当你无从下手的时候，直接点 OK，接受这些默认参数，开始计算多序列比对。
Alignment Explorer 窗口上点 Data 》 Export Alignment 》MEGA Format。注意这里一定选 MEGA format 以方便
MEGA 继续加工。其他格式适用于其他软件。
多序列中，出现最多的字母，为共有序列
点击C按钮，出现保守序列，标黄色
点击V按钮，标黄不保守的列，可以取消打勾淘汰序列，不参与建树
点击分页，创建分组
点彩色方块，修改为短名字。名字来源于fasta的>标题
准备工作全部完成。
选 Neighbor Joining（最近邻居法）
点击yes，是使用TIR.meg的数据。
参数设置，影响树的构造，一般默认建树后，重新调整参数，让树更美观。
第一个参数：
Test of Pylogery 建树的检验方法设置，默认为不进行检验，检验方法，可以选常用的 Bootstrap method(步长检验)
并设置检验的倍数，通常设为500。
步长检验是根据所选的建树方法，计算并绘制指定次数株系统发生树。因为大多数建树方法的核心算法都是统计概率模型，所以每次计算出的树都会有所差别。而建好的系统发生树上每个节点上都会标记一个数字，它代表了指定次数次计算所得出的系统发生树中有百分之多少棵树都含有这一节点。一般来说，绝大多数节点上的数值都大于 70%的树才可信。个别低于 70%的节点可以暂且容忍，或通过添加，删减序列来改善质量。
第二个参数：
Substitution Model。它是选择计算遗传距离时使用的计算模型。理论上应该尝试各种模型，根据检验结果选择最合适的模型进行计算。但在实际操作中，可先尝试选用较简单的距离模型，比如 p-distance。
第三个参数是 Gap/Missing Data Treatment。
大多数建树方法会要求删除多序列比对中含有空位的列。但是根据遗传距离度量方法的不同，删除原则也不同。如果是以序列间不同残基的个数来度量遗传距离的话，这里需要选择 Complete deletion（全部删除）。如果是其他方
法，比如这里选用的 NJ 方法，可以选择 Partial deletion（部分删除）。删除程度定在 50%，即，保留一半含有空位的列。
按compute，开始计算系统发生树。
这个窗口里有两个标签页。
第一个是 Original Tree（原始树），
第二个是 Bootstrap consensus tree（步长检验合并出来的树）。
当前构
建的这株系统发生树中，绝大多数节点处的数值都是≥70 的，所以这株树整体上是可信的。
Original Tree 是步长检验构建的 500 株树中的一株，未经过多棵树合并，所以树枝的长短可以精确代表遗传距离。
比如，TLR5 似乎脱离了CM 组，成为了外类群，从而确定了树根。
下机数据经过过滤去除接头含量过高或低质量的reads，得到clean reads用于后续分析。常见的trim软件有Trimmomatic、Skewer、fastp等。fastp是一款比较新的软件，使用时可以用--adapter_sequence/--adapter_sequence_r2参数传入接头序列，也可以不填这两个参数，软件会自动识别接头并进行剪切。如：
fastp \
--in1 A1_1.fq.gz \ # read1原始fq文件
--out1 A1_clean_1.fq.gz \ # read1过滤后输出的fq文件
--in2 A1_2.fq.gz \ # read2原始fq文件
--out2 A1_clean_2.fq.gz \ # read2过滤后输出的fq文件
--cut_tail \ #从3’端向5’端滑窗，如果窗口内碱基的平均质量值小于设定阈值，则剪切
--cut_tail_window_size=1 \ #窗口大小
--cut_tail_mean_quality=30 \ #cut_tail参数对应的平均质量阈值
--average_qual=30 \ #如果一条read的碱基平均质量值小于该值即会被舍弃
--length_required=20 \ #经过剪切后的reads长度如果小于该值会被舍弃
fastp软件的详细使用方法可参考：https://github.com/OpenGene/fastp。fastp软件对于trim结果会生成网页版的报告，可参考官网示例http://opengene.org/fastp/fastp.html和http://opengene.org/fastp/fastp.json，也可以用FastQC软件对trim前后的数据质量进行评估，FastQC软件会对单端的数据给出结果，如果是PE测序需要分别运行两次来评估read1和read2的数据质量。
如：
fastqc A1_1.fq.gz
fastqc A1_2.fq.gz
FastQC会对reads从碱基质量、接头含量、N含量、高重复序列等多个方面对reads质量进行评估，生成详细的网页版报告，可参考官网示例：http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/good_sequence_short_fastqc.html
经过trim得到的reads可以使用BWA、bowtie2等软件进行比对。首先需要确定参考基因组fa文件，对fa文件建立索引。不同的软件有各自建立索引的命令，BWA软件可以参考如下方式建立索引：
bwa index genome.fa
建立好索引后即可开始比对，ATAC-seq推荐使用mem算法，输出文件经samtools排序输出bam：
bwa mem genome.fa A1_clean_1.fq.gz A1_clean_2.fq.gz
| samtools sort -O bam -T A1 >A1.bam
值得注意的是，在实验过程中质体并不能完全去除，因此会有部分reads比对到质体序列上，需要去除比对到质体上的序列，去除质体序列可以通过samtools提取，具体方法如下：首先将不含质体的染色体名称写到一个chrlist文件中，一条染色体的名称写成一行，然后执行如下命令即可得到去除质体的bam
samtools view -b A1.bam $chrlist >A1.del_MT_PT.bam
用于后续分析的reads需要时唯一比对且去重复的，bwa比对结果可以通过MAPQ值来提取唯一比对reads，可以用picard、sambamba等软件去除dup，最终得到唯一比对且去重复的bam文件。
比对后得到的bam文件可以转化为bigWig（bw）格式，通过可视化软件进行展示。deeptools软件可以实现bw格式转化和可视化展示。首先需要在linux环境中安装deeptools软件，可以用以下命令实现bam向bw格式的转换：
bamCoverage -b A1.bam -o A1.bw
此外，可以使用deeptools软件展示reads在特定区域的分布，如：
computeMatrix reference-point \ # reference-pioint表示计算一个参照点附近的reads分布，与之相对的是scale-regions，计算一个区域附近的reads分布
--referencePoint TSS \#以输入的bed文件的起始位置作为参照点
-S A1.bw \ #可以是一个或多个bw文件
-R gene.bed \ #基因组位置文件
-b 3000 \ #计算边界为参考点上游3000bp
-a 3000 \ #计算边界为参考点下游3000bp，与-b合起来就是绘制参考点上下游3000bp以内的reads分布
-o A1.matrix.mat.gz \ #输出作图数据名称
#图形绘制
plotHeatmap \
-m new_A1.matrix.mat.gz \ #上一步生成的作图数据
-out A1.pdf \ # 输出图片名称
绘图结果展示：
MACS2能够检测DNA片断的富集区域，是ATAC-seq数据call peak的主流软件。峰检出的原理如下：首先将所有的reads都向3'方向延伸插入片段长度，然后将基因组进行滑窗，计算该窗口的dynamic λ，λ的计算公式为：λlocal = λBG（λBG是指背景区域上的reads数目），然后利用泊松分布模型的公式计算该窗口的显著性P值，最后对每一个窗口的显著性P值进行FDR校正。默认校正后的P值（即qvalue）小于或者等于0.05的区域为peak区域。需要现在linux环境中安装macs2软件，然后执行以下命令：
macs2 callpeak \
-t A1.uni.dedup.bam \ #bam文件
-n A1 \ # 输出文件前缀名
--shift -100 \ #extsize的一半乘以-1
--extsize 200 \ #一般是核小体大小
--call-summits #检测峰顶信息
注：以上参数参考文献（Jie Wang，et.al.2018.“ATAC-Seq analysis reveals a widespread decrease of chromatin accessibility in age-related macular degeneration.”Nature Communications）
ATAC分析得到的peak是染色质上的开放区域，这些染色质开放区域常常预示着转录因子的结合，因此对peak区域进行motif分析很有意义。常见的motif分析软件有homer和MEME。以homer软件为例，首先在linux环境中安装homer，然后用以下命令进行motif分析：
findMotifsGenome.pl \
A1_peaks.bed \ #用于进行motif分析的bed文件
genome.fa \ #参考基因组fa文件
A1 \ #输出文件前缀
-size given \ #使用给定的bed区域位置进行分析，如果填-size -100,50则是用给定bed中间位置的上游100bp到下游50bp的区域进行分析
homer分析motif的原理及结果参见：http://homer.ucsd.edu/homer/motif/index.html
根据motif与已知转录因子的富集情况可以绘制气泡图，从而可以看到样本与已知转录因子的富集显著性。
差异peak代表着比较组合染色质开放性有差异的位点，ChIP-seq和ATAC-seq都可以用DiffBind进行差异分析。DiffBind通过可以通过bam文件和peak的bed文件计算出peak区域标准化的readcount，可以选择edgeR、DESeq2等模型进行差异分析。
在科研分析中我们往往需要将peak区域与基因联系起来，也就是通过对peak进行注释找到peak相关基因。常见的peak注释软件有ChIPseeker、homer、PeakAnnotator等。以ChIPseeker为例，需要在R中安装ChIPseeker包和GenomicFeatures包，然后就可以进行分析了。
library(ChIPseeker)
library(GenomicFeatures)
txdb<- makeTxDbFromGFF(‘gene.gtf’)#生成txdb对象，如果研究物种没有已知的TxDb,可以用GenomicFeatures中的函数生成
peakfile <-readPeakFile(‘A1_peaks.narrowPeak’)#导入需要注释的peak文件
peakAnno <- annotatePeak(peakfile,tssRegion=c(-2000, 2000), TxDb=txdb)
# 用peak文件和txdb进行peak注释，这里可以通过tssRegion定义TSS区域的区间
对于peak注释的结果，也可以进行可视化展示，如：
p <- plotAnnoPie(peakAnno)
通过注释得到的peak相关基因可以使用goseq、topGO等R包进行GO富集分析，用kobas进行kegg富集分析，也可以使用DAVID在线工具来完成富集分析。可以通过挑选感兴趣的GO term或pathway进一步筛选候选基因。
或许，没有人知道TBtools到底是什么？能干啥。
但是看完这个推文，或许你就知道了其中的一部分。
TBtools对外开放两年多，不时会有熟悉的不熟悉的人与我聊到TBtools。TBtools在每个人的认知上，或许都不一样。
有的人觉得TBtools就是 耽误了他们所谓的生物信息学习 。
有的人说，TBtools 保了他们毕业 。
也有的人说，TBtools 帮助了他发了文章
更或者，TBtools。。。
三年前开始写TBtools。功能很简单，主要是做做序列提取，也做了BlastWrapper（当时并不稳健）。目的很纯粹，课题组的人不会找我提取序列，也可以直接Blast到转录组找序列。那时候接触TBtools的朋友，或许都这么认为。
当然，后来我对这方面进行了各种增强，也保证了其现在的稳健性。 一个输入窗口，支持不同的输入 ，无论是提取序列全长，还是提取序列区段；不仅支持ID提取，还支持ID子串匹配...
此外，也增加了基于gff3进行序列提取的功能，比如提取所有序列的全长CDS，全长EXON，甚至是 可以批量一次性提取一个物种的所有启动子序列。
除了Blast Wrapper，可能还需要调用外部程序的，那么是muscle（主要是我实现的NW算法运行效率一般，用到多序列比对，就不提了）
可以从一个子菜单看到
功能相对丰富，包括
无论是两条序列的直接比较，还是两个序列文件，甚至是两个基因组的两个指定区间的Blast，TBtools中都已经提供了GUI；不仅于此，四种可视化方式，常常能满足大多数人的需求。
比如
后来，由于Blast2GO太慢了。基于IDmapping的逻辑，我大体写了一个GO注释的功能。当然，更重要的或许是直接写了GO和KEGG富集分析的功能。所以后来，也有不少做非模式生物的朋友认为，TBtools事实就做这个事情。其中也包括一些可视化，比如GO Level2的可视化。后来，我也写了一些富集结果的可视化。
慢慢地，我发现，网页版工具，如Venny，明明是很小的韦恩图绘制功能，网络太差，等待缓冲总是占用了我太多的时间。应该本地化。所以我索性写了一个 最高支持六组的Venn图 工具。当然，也有后来的UpsetPlot工具。
基因展示在染色体上的，类似MapChart的工具等。
此外也由于一些工具，如热图绘制上，我觉得用起来真的不顺手。或者参数太少，或者不容易调整各种细节。所以我也写了热图工具。
所以，或许确实有的朋友就觉得，你这工具，就是一个画图工具包。
Venn图与UpSetPlot
当然，你还可以直接绘制SeqLogo
基于前面我发送过的推文，总的来说，有了TBtools， 所有人无需任何一行命令，也不需要Linux或者虚拟机操作，可以完成常见的基因家族分析。
大体包括的工具有：
似乎， 有一些培训机构提供的线上线下的基因家族分析培训，需要使用的各种虚拟机，Linux，命令，脚本 ，统统都可以扔掉。常见的基因家族分析项目，可能只需要TBtools就完全足够了。
为此，慢慢地开始有朋友给TBtools下了定义： TBtools是一个基因家族分析工具包 。在我看来，事实上，这些朋友对TBtools有很大的误解。我从来就没想过写一个基因家族分析工具。不是因为TBtools要做一个基因家族分析工具，而是因为基因家族分析本身就是 所有人都需要，都懂的生物数据分析的基本技能 。我只是简化这些技能的实现。
正如下面，我所写的TBtools中，或许很多人想想不到功能一样。
与其说TBtools是你以为的基因家族分析工具，你不如说他是比较基因组分析工具，那么还显得高大上一些。
这半个月以来，课题组的安排下，我参与了一些基因组分析相关的工作；
基因组分析，本身确实是一个 耗费智力和体力 的活。分析过程中，也发现了一些或许可以 让所有人都从中获取生物信息 的分析手段。
于是我 花了两个晚上 的时间，写了几个工具。
加上一些以前TBtools中就有的工具，相信对做 基因组分析 的朋友会有一定的帮助。
但是，请注意，除非是赞助我们课题组的户外拓展活动或者合作单位，否则我并不保证这些工具的使用。
MCScanX是比较基因组分析中常用的工具。我已经将其打包到TBtools中，所以即使是windows用户，也可以轻松进行分析。此外，也不要求用户保证gff文件和blast文件的名字一致。
关于这个工具... 详细见公众号以前的推文。
Ka/Ks的计算，常常会被人问题。事实上，如果只是简单的进行 NG 算法的计算，是非常容易实现的。目前用的广泛的，或许是KaksCalculator2和PAML。这两个软件都是大牛级的软件。在TBtools中，我终于还是开放了去年还是前年实现的NG计算逻辑，并打了非常方便的GUI。用户几乎只有有CDS序列和基因对信息就可以直接进行计算，而完全不用浪费时间在文件格式整理上。
工具是不断地优化和发展的。
分析门槛也是会被不断打破的。
或许让所有人，都能有开展一些分析的能力，也是推进一些事物发展的方式。
欢迎尚未加到TBtools使用交流QQ群的朋友，加入
课题组每年暑期有 内部生信入门培训 ，主要是对实验室新生开展（以及湿实验为主的成员）培训。一直有收到其他课题组想要了解 我们课题组生信数据分析 的想法。故，在博导的提议和课题组的讨论后，我们近期计划，在本年度暑期（7~8月份之间） 对外 增设 生信基础培训 名额10枚（前面每年只是课题组内培训，而不对外）。具体请见 https://mp.weixin.qq.com/s/OtmeTErd9f9rvjJPtBKjMw
园艺植物小分子RNA与基因组研究 -夏瑞课题组
课题组主页： http://xialab.scau.edu.cn/
晁无咎，名补之，明远四世孙也。善属文，与苏子瞻、黄鲁直善。官至吏部郎中，兼国史编修。历知州府有惠政，在齐州尝活流民数千人。年二十余即归向正法，深信因果。与圆通觉海诸禅师游，参求向上事。崇宁二年，卫州民杀猪，有犬[衔-止+山]猪首骨去，狺狺四日不食，或异而析之，于左牡齿臼中得肉如拇，如来像也，髻有粟如珠，绀目跏趺，庄严毕具。无咎弟载之亲见其事，记于石以示无咎。无咎曰：“佛菩萨誓救众生，至不爱头目髓脑，度人畜身，出无量苦。而具缚凡夫以利养故，杀害不巳，俱入剧苦大火坑中。佛菩萨动于威神，为警此辈因惧生信。于沸镬汤莲花涌出，戒悔杀害普作回向。由是增长深般若因，为一切诸佛之所护念，岂不胜哉？”乃作赞曰：“吾观鸟兽，诸食肉形，钩吻锯牙，惨剧罗刹。如是一类，是强非强，业力所驱，啖彼养已。是遭食者，死巳能生，反诛其偿，如汝淊我，版筑上下，无有尽时，此业甚深，佛所不度。牛马草食，口方齿平，业浅易超，无对复苦。人非牛马，齐贝瓠犀，食谷果蔬，形善应尔。云何不若，牛马异生，无凶吻牙，而作锋刃，鹰虎受报，形凶则然，人形佛形，而惨鹰虎，故死受报，甚于马牛。我诵此言，普劝横目，血入牙故，杀生不休。至人无心，同仁一视，视人如我，视猪如人，人自不智，是猪何等？或其前世，诸眷属因，云何无明，日杀眷属？刺心取血，血大壑流，扬汤燖毛，毛须弥聚。死者不舍，万猪常随，汝莫鼓刀，谓猪贱畜。是热血里，有丈六身，南无佛陀，南无僧伽，我不敢杀，诸佛现前，一切众生，若飞若走，若潜若穴，大小妍[媏-而/一/虫]，其血肉中，各具一佛。云何见佛，而欲鼓刀？汝欲杀猪，应作是念，[罽-厂]宾国王，杀尊者时，未及舍刀，臂巳堕落，白乳涌出，六种震惊，亦如此猪，脑破佛出，佛不在外，佛不在中，佛不在空，佛不在色，是猪不死，彼佛俨然。世分别心，自说人贵，谓羊豕业，本以供人，彼以业来，我何故受？受则羊豕，业归吾身，往有大猪，生不啖秽，食薄荷草，度群业猪，菩萨威神，示入异类，汝自肉眼，何由识猪？藏汝之刀，莫加猪首，惊齿臼内，跏趺坐人，稽首世尊，在我齿臼，我不敢慢，无猪无人，惟愿现前，诸见闻者，如菩萨誓，念念勿疑，以此胜因，普荐三世，父母师长，若冤若亲，化柔软心，去毒害意，舍热血汁，获甘露浆，苦海悉干，同一安隐。”又尝作《宴坐文》云：“平居宴坐，闭目收虑，恒作是语，汝身今者，非男非女，非孙非祖，无古无今，无来无去，清净本然，妄生国土，被尘染识，根乃结聚，久不可洗，如衣受渍，妄有形骸，妄有名字，是张是李，是男是女，汝既非此，此亦非汝，譬如蚝相，被石粘住，认石为我，千劫受苦，是义不然，吾有一喻，譬我如空，被钉钉住，是空非物，钉无著处，便得脱然，离我我所，正恁么时，揩眼看取，一念相应，是涅盘路。”大观中知泗州，卒年五十八，从弟说之字以道，官至徽猷阁待制，尝访湖南明智法师学天台教观，晚年日诵《法华经》不辍云。(宋史鸡肋集佛法金汤)
晁无咎词
六卷（江苏巡抚采进本）
宋晁补之撰。补之有《鸡肋集》，已著录。是集《书录解题》作一卷，但称晁无咎词。《柳塘词话》则称其词集亦名鸡肋，又称补之常自铭其墓，名《逃禅词》。考杨补之亦字无咎，其词集名曰《逃禅》。不应名字相同，集名亦复蹈袭，或误合二人为一欤？此本为毛晋所刊，题曰《琴趣外篇》。其跋语称《诗馀》不入集中，故名《外篇》。又分为六卷，与《书录解题》皆不合，未详其故。卷末《洞仙歌》一首，为补之大观四年之绝笔，则旧本不载，晋摭黄升《花庵词选》补录於后者也。补之为苏门四学士之一。集中如《洞仙歌》第二首填卢仝诗之类，未免效苏轼《隐括》、《归去来词》之颦。然其词神姿高秀，与轼实可肩随。陈振孙於《淮海词》下记补之之言曰：“少游词如‘斜阳外，寒鸦数点，流水绕孤村’，虽不识字人，亦知是天生好言语。”观所品题，知补之於此事特深，不但诗文之擅长矣。刊本多讹，今随文校正。其《引驾行》一首，证以柳永《乐章集》及集内《春云轻锁》一首，实佚其后半。无从考补，今亦仍之。至《琴趣外篇》，宋人中如欧阳修、黄庭坚、晁端礼、叶梦得四家词皆有此名，并补之此集而五，殊为淆混。今仍题曰《晁无咎词》，庶相别焉。
-
---出《四库总目提要》
吴梦窗的《风入松》赏析
吴文英，字梦窗，是南宋姜派有名的词人，历来对他的作品有不同的评价。有的说他的词“如七宝楼台，眩人眼目，碎拆下来，不成片段”。多数词人、评论家，则说他的作品细致、奇丽、沉着，“能令无数丽字一一生动飞舞，如万花为春”。
有人说，吴文英的词风“刻意追求形式，讲求词法，雕琢字面，推敲声韵，与姜夔、史达祖成为南宋后期形成的以格律为主的宗派”。
吴文英的词，从内容上讲，可取处不多，但在表现艺术方面，值得学习的地方却不少。现在试取他的名篇(风入松)来分析、欣赏一番。
这首词，我很赞赏它，常记在心上，不时吟诵。这是一首写爱情的词，写得感情真切，细致入微，委婉动人。“听风听雨过清明。愁草瘗花铭。”一开头，把场景布置得凄清感人，给抒情定出了基调。好似《西厢记》里一双爱人分离时候的描写：“碧云天，黄花地，西风紧，北雁南飞。”清明节，是一年中最美好的良辰，嫩柳垂金，杏桃花发，该是赏心悦目、无限欢欣的季节；但是呵，天不作美，又是风，又是雨，真是三分春色，二分风雨，一分尘土。花儿被无情风雨打得落红满地，人的心情被搅得抑郁不舒。我们多愁善感的诗人词客，愁绪萦怀，不能去郊游赏春，看不到晴天丽日，却闷闷地在琢磨着，为被葬埋的花儿写一首不胜惋惜的“碑铭”。这两句，写了景，写了触景而生的伤春之情。但妙处却是，我们的词人，实际上不是真的为落花感触，而是为了与情人分手而伤怀。接下去，点明了这伤怀的真实情况，原来是为了：“楼前绿暗分携路，一丝柳，一寸柔情。”情绪恶劣，是为了风雨吗?发愁是为了葬花吗?不是，是为了和情侣分手呵。一个“暗”字，暗示了别离的时刻，大约已近黄昏，否则，嫩柳鹅黄，哪能说“暗”?与情人别离，独自归来，自斟自酌，聊以消愁，“料峭春寒中酒”，情绪不佳，自然易醉呵。大约有点损眠，酒后虽然入睡，恐怕也有点朦朦胧胧，天刚亮就醒来了：“交加晓梦啼莺”。心里已经被离情缠绕着，春寒中酒，又在损眠之后，枕上听群莺乱啼，心中是个什么滋味?
这是《风入松》的上半阕——写眼前景，写心中情。下半阕，开始了甜蜜而又酸楚的回忆：“西园日日扫林亭，依旧赏新晴。”情人不在一起，天天还是去把西园的林亭打扫一番，独个儿欣赏撩人的大好春色。这是眼前的实景，目的却在写情人不在的孤独心情，也就是反映和她在一起时那种良辰美景，并肩共赏的光景与心境。“黄蜂频扑秋千索，有当时纤手香凝。”想到和情人一道在林园时的欢快，而今空馀秋千绳索上的手泽，惹得黄蜂扑来。看到的，想到的，闻到的，无一不带上当时的欢乐、今日的怅惘之情。“惆怅双鸳不到，幽阶一夜苔生。”这结尾两句，比《西厢记》里的“他若是到来，便春生敝斋；他若是不来，似石沉大海”，更加深沉，更加柔婉，更加凄清。读了之后，真是令人郁郁，一吟三叹。不胜惋惜。
这首词，不论是写景，写情，写现实，写回忆，都细致、真挚、委婉，脉络清晰可按，语意缠绵，音调和谐，令人一读再读，不忍释手。艺术的伟力、魅力，有如此者!胡云翼在《宋词选》“前言”中说吴文英是“依附于统治阶级以清客身份出现的词人”，这是对他的政治态度、词的思想内容说的。从这首词中，也可以看出作者的身份。有楼台，有园林，有闲情逸致；但也有他的绚丽文彩，湛深的艺术功力。
附吴文英《风入松》： 听风听雨过清明，愁草瘗花铭。楼前绿暗分携路，一丝柳，一寸柔情。料峭春寒中酒，交加晓梦啼莺。
西园日日扫林亭，依旧赏新晴。黄蜂频扑秋千索，有当时纤手香凝。惆怅双鸳不到，幽阶一夜苔生。 【原载】 《北京日报》
